Brookhaven 국립 연구소 미국 에너지성에 과학자는 개발했습니다 것 의 불명한 "미생물 지역 사회에서 살아 미생물의 많은 종 확인을 위한 높 처리량 기술."
적용되는 환경 미생물학의 3월 2006일 문제점에서 기술된 방법에는, 많은 응용이 있습니다 -- 세균 평가에서 환경 견본에서 병원체를 확인하고 잠재적인 bioterror 무기와 무해한 박테리아 구별하기 오염 청소를 위해 유용한 확인 종 제출하거든.
"미생물 지역 사회 거대하게 다양하 복잡한, 근해의 밀리 리터 토양의 그램 당 수천 당 종의 수백과 더불어,"는 Brookhaven 생물학자를 말했습니다 다니엘 (Niels) van der Lelie, 연구 결과의 수석 저자. "이 복합성을 설명하는 것은 우리가 완전히 글로벌 주기에 있는 역할 세균 실행을 이해하고 싶은 경우에 필수적, 사용합니다 그들의 거대한 신진 대사 기능을입니다, 또는 쉽게 확인하십시오 인류 건강에 잠재적 위협을."
종을 확인하는 세균의 성장하고 있는 문화는 문화 조건이 수시로 지역 사회의 중요한 일원을 가려내기 때문에 느립니다 오류 빈발 입니다. 전체 게놈을 연속은, 높게 특정 및 유익할 것이, 너무 노동집약 및 값이비쌀. 따라서 과학자는 충분히 짧 급속하게 연속 위하여 종 중 즉시 구별할 수 있는 유전 암호의 중요한 세그먼트를 확인하는 쪽을 찾고 있습니다.
Brookhaven 팀은 "단일 지점에게 게놈 서명 표를 붙이는이라고." 칭하는 다만 그런 기술을 개발했습니다, 유전 암호에 있는 특정 순서를 인식하는 효소를 사용하여, 모든 미생물 종에 일반 인식기 유전자를 포함하는 충분한 유일한 유전 정보 플러스 작은 세그먼트로 미생물 세균을 따로따로 말하기 위하여 게놈을 잘게 자릅니다.
1개의 보기에서는, 과학자는 생성에 그 유전자의 시작부터 유전 암호의 16"를 약간 "상류로" 써 넣는" 리보솜의 피스를 위한 부호를 포함하는 DNA의 피스를 "표를 붙입니다" 삭감하고 접합합니다 -- 높게 보전된 "단일 지점" 참고 유전자. 이 꼬리표를 연속 알려진 세균성 게놈의 데이타베이스와 순차 코드를 비교해서, Brookhaven 팀은 속 수준에 모든 공동체 회원을 아래로 확인하기 위하여 이 특정 16 편지 지구가 충분한 유일한 유전 정보를 성공적으로 포함한다는 것을, 및 최대량 또한 결정했습니다 수평 종에.
"연속은 비쌉니다, 그래서 더 낫것을 할 수 있으면 연속과 아직도 유용한 정보 더 짧은 단면도, 입수하기 위하여," van der Lelie는 말했습니다. "이 꼬리표가 아주 짧기 때문에 실제로, 우리는 10에서 모두를 "함께 접착제로 붙여", 하 이것에게 매우 능률적인 한번에 연속, 그(것)들의 30를 비용 효과적인 기술을."
이미 연속 세균성 게놈에 수 없는 꼬리표 순서를 위해 한 쌍 백은 일치할인지 거기 어느 것 (의), 과학자는 프라이머로 전체 붙어 있던 ribosomal 유전자를 연속 위하여 꼬리표를 이용할 수 있습니다. 이 유전자는 오래 대략 1400의 유전 부호 편지입니다, 그래서 이것은 시간이 걸리는 더 비싼 업무입니다. 그러나 ribosomal 유전자가 100,000 세균성 종에서 연속 분류되었기 때문에, 이것은 "ribotyping" 기술 비교를 위한 광대한 데이타베이스를 사용합니다.
"지금도 아무 일치도 없는 경우에," van der Lelie를 말했습니다, "그 때 꼬리표는 아마 또한 아주 흥미로운!" 아주 새로운 종을 확인합니다,
bioterror 공격에서 이용된 에이전트 확인을 위한 가능한 응용을 가진 다른 시험에서는, 기술은 또한 간균 손가락 선인장, 병원성 토양 세균 및 간균 anthracis, 탄저병의 세균성 원인의 밀접한 관계가 있 긴장 사이에서 명확하게 감별했습니다.
이 기술은 또한 미생물 지역 사회 구성이 환경에 있는 변경에 어떻게 반응하는지 평가하는 것을 도울 수 있었습니다. 그 같은 정보는 종의 어느 조합이 말하자면, 탄소를 격리시키거나 방사선학적인 오염 청소하기에 가장 적합할 것입니다지 확인하는 것을 도울지도 모릅니다.
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