Os Cientistas no Ministério de E.U. do Laboratório Nacional do Brookhaven da Energia desenvolveram uma nova, técnica da alto-produção para identificar muitas espécies de micro-organismos que vivem “em uma comunidade microbiana desconhecida.”
O método, descrito na introdução De março de 2006 de Microbiologia Ambiental Aplicada, tem muitas aplicações -- de avaliar os micróbios apresente em amostras ambientais e espécie da identificação útil para limpar a contaminação a identificar os micróbios patogénicos e a distinguir as bactérias inofensivas das armas potenciais do bioterror.
“As comunidades Microbianas são enorme diversas e complexo, com centenas de espécies pelo mililitro da água ou os milhares pelo relvado do solo,” disse o biólogo Daniel de Brookhaven (Niels) camionete der Lelie, autor principal do estudo. “Explicar esta complexidade é essencial se nós queremos compreender inteiramente o jogo dos micróbios dos papéis em ciclos globais, utiliza suas capacidades metabólicas enormes, ou identifique facilmente ameaças potenciais à saúde humana.”
Crescer culturas dos micróbios para identificar a espécie é lento e sujeito a erros porque as condições da cultura seleccionam frequentemente para fora membros importantes da comunidade. Arranjar Em Seqüência genomas inteiros, quando altamente específico e informativo, seria demasiado labor - intensivo e caro. Os cientistas têm procurarado Assim por maneiras de identificar os segmentos chaves do código genético que são curtos bastante ser arranjados em seqüência ràpida e podem prontamente distinguir entre a espécie.
A equipe de Brookhaven desenvolveu apenas tal técnica, que chama “única colocação de etiquetas da assinatura do genoma do ponto.” Usando as enzimas que reconhecem seqüências específicas no código genético, desbastam os genomas microbianos nos segmentos pequenos que contêm os genes do identificador comuns a toda a espécie microbiana, mais bastante informação genética original para dizer distante os micróbios.
Em um exemplo, os cientistas cortam e emendam as partes de ADN ao produto “etiquetam” que contêm 16" rotulam” do código genético um tanto “rio acima” desde o início do gene esse códigos para uma parte do ribosome -- do “o gene altamente conservado da referência único ponto”. Arranjando em seqüência estas etiquetas e comparando o código arranjado em seqüência com as bases de dados de genomas bacterianos conhecidos, a equipe de Brookhaven determinou que esta região da letra do específico 16 contem bastante informação genética original para identificar com sucesso para baixo todos os membros da Comunidade ao género nível, e a maioria à espécie em nível também.