Научные Работники на Министерстве Энергетики США Лаборатория Брукхейвен Национальная начали новую, метод высок-объём для определять много видов микроорганизмов живя в неизвестной «микробной общине.»
Метод, описанный в вопросе Марта 2006 Прикладной Относящой К Окружающей Среде Микробиологии, имеет много применений -- от определять микробы представьте в относящих к окружающей среде образцах и вид определять полезный для очищать вверх загрязнение к определять патогены и различать невредные бактерии от потенциальных оружий bioterror.
«Микробные общины преогромно разнообразны и сложно, с сотниами видов в миллилитр воды или тысячи в грамм почвы,» сказал биолога Даниель Брукхейвен (Niels) фургон der Lelie, ведущего автор изучения. «Разъяснять эту сложность необходим если мы хотим полно понять игру микробов ролей в глобальных циклах, то использует их преогромные метаболически возможности, или легко определите потенциальные угрозы к здоровьям человека.»
Растущие культуры микробов для того чтобы определить вид медленны и подверженный ошибкам по мере того как условия культуры часто экранируют вне важные члены общины. Sequencing все геномы, пока сильно специфическо и информативно, был бы слишком трудоёмок и дорог. Так научные работники искали для путей определить ключевые этапы генетического Кода которые коротки достаточно быть sequenced быстро и могут охотно различить среди вида.
Команда Брукхейвен начинала как раз такой метод, который они вызывает «одноточечный маркировать подписи генома.» Используя энзимы которые узнают специфические последовательности в генетическом Коде, они прерывают микробные геномы в малые этапы которые содержат гены обозначения общие к всему микробному виду, плюс достаточная уникально генетическая информация для того чтобы сказать микробы врозь.
В одном примере, научные работники режут и соединяют части ДНА к продукции «маркируют» которые содержат 16" помечают буквами» генетического Кода несколько «перед» с начала гена того Коды для части рибосомы -- сильно сохраненный «одноточечный» ген справки. Путем sequencing эти бирки и сравнивать sequenced Код с базами данных известных бактериальных геномов, команда Брукхейвен определила что эта зона письма специфического 16 содержит достаточную уникально генетическую информацию успешно для того чтобы определить все члена общины вниз к роду уровню, и большая часть к виду ровному также.