miRNA MRNA 相互作用の新しいゲノム全体のマップ

比較機能ゲノミクスのためのニューヨーク大学の中心および、バークレーカリフォルニア大学の研究者は動物のモデル有機体の microRNA (miRNA) ターゲット、 Caenorhabditis の elegans (C. の elegans) のゲノム全体のマップを予測するのに計算の分析を使用しました。

呼出される特定のセクションの伝令RNA (mRNA) への MicroRNAs の縛りは 3' UTR、それらを調整すると知られ。 予測されたマップの部分は尋ねた新しい生体内の方法の開発によって 3つは生きている有機体の開発の間に mRNAs の UTR の部品規則を運転するかどうか確認されました。 研究は現在の生物学の最新問題で現われます。

miRNA ターゲットのマップで、調査チームは C. の elegans のゲノム、胚がどのように成長するか調査するためにゲノムが完全にモデル有機体配列された最初の動物種の機能を検査し。 PicTar を使用して、 NYU で開発されたアルゴリズムは研究者 C. の elegans の遺伝子の miRNA 機能を予測しました。 研究者は C. の elegans の miRNAs ターゲット遺伝子セットの 3 分の 1 が機能を関連付けたことが分りました。 すなわち、 miRNAs が特定の生物学的過程ではたらく遺伝子の制御グループできるようです。 C. の elegans の遺伝子の少なくとも 10% 予測された miRNA ターゲットです。

計算の予言をテストするためには、 NYU のチームはレポーター、緑の蛍光蛋白質の運送ターゲット 3' の表現を比較する新しい生体内の (GFP)解析システムをターゲット 3' を UTRs 運ばなかった制御を用いる UTRs 開発しました。 実験室の結果は遺伝子発現の抑制に於いての細目 3' の役割を UTRs 3つが UTRs 遺伝子の規則のための主として未踏査の宇宙を含んでいることを提案する計算の分析によって予測されるより広く確認しました。

たくさんのゲノム全体の miRNA は線虫のための予言を目標とします、または回虫、人間およびはえは PicTar のウェブサイト (pictar.bio.nyu.edu) から使用でき、 NYU の中心で発達する比較機能ゲノミクスのための新しく写実的なネットワーク閲覧のツールにリンクされます。 これはさまざまな機能 genomic データリソース (gnetbrowse.org) という点において miRNA ターゲット予言の調査を可能にします。

http://www.nyu.edu