miRNA MRNA 상호 작용의 새로운 게놈 넓은 지도

비교 기능적인 유전체학을 위한 뉴욕 대학의 센터 및, 버클리 가주 대학에 연구원은 컴퓨터 동물성 모형 유기체에 있는 microRNA (miRNA) 표적, Caenorhabditis elegans (C. elegans)의 게놈 넓은 지도를 예상하기 위하여 분석을 이용했습니다.

불린 특정 단면도에서 메신저 RNA (mRNA)에 MicroRNAs 묶는 것은 3' UTR, 그(것)들을 통제하기 위하여 알려지고. 예상된 지도의 부분은 질문한 비발한 생체 조건 방법의 발달을 통해 3개은 살아있는 유기체에 있는 발달 도중 mRNAs의 UTR 부속 규칙을 모는지 확인되었습니다. 그들의 연구는 현재 생물학의 최근 문제점에서 나타납니다.

miRNA 표적을 지도로 나타내기에서, 연구단은 C. elegans의 게놈, 태아가 어떻게 발전하는지 공부하기 위하여 그의 게놈이 완전하게와 모형 유기체 연속 첫번째 동물성 종의 기능을 검토했습니다. PicTar를 사용하여, NYU에 개발된 산법은, 연구원 C. elegans 유전자의 miRNA 기능을 예상했습니다. 연구원은 C. elegans miRNAs 표적 유전자 세트의 1/3가 기능을 관련시켰다는 것을 것을을 발견했습니다. 다시 말하면 miRNAs가 특정 생물학 프로세스에서 작동하는 유전자의 통제반 할 수 있다 나타납니다. C. elegans 유전자의 적어도 10% 예상한 miRNA 표적입니다.

컴퓨터 예측을 시험하기 위하여는, NYU 팀은 취재원, 녹색 형광성 단백질 전송 표적 3'의 표정을 비교하는 새로운 생체 조건 (GFP) 분석 체계를 표적 3'을 UTRs 전송하지 않은 통제를 가진 UTRs 개발했습니다. 실험실 결과는 유전자 발현 억압에 있는 특성 3'의 역할을 UTRs 3개이 UTRs 유전자 규칙을 위한 크게 탐험되지 않는 우주를 포함한다는 것을 건의하는 컴퓨터 분석에 의해 예상되는 보다는 더 넓게 확인했습니다.

게놈 넓은 miRNA의 수천은 선충을 위한 예측을 표적으로 합니다, 또는 회충, 인간 및 비행거리는 PicTar 웹사이트 (pictar.bio.nyu.edu)에서 가능하 NYU 센터에서 발육된 비교 기능적인 유전체학을 위한 새로운 그래픽 통신망 찾아보 공구에 연결됩니다. 이것은 각종 기능적인 genomic 데이터 자원 (gnetbrowse.org)의 환경에서 miRNA 표적 예측의 탐험을 허용합니다.

http://www.nyu.edu