miRNA MRNA 交往新的染色体映射

研究员在纽约比较功能染色体组的大学的中心和加州大学，伯克利使用计算分析预测染色体映射在动物模型有机体的 microRNA (miRNA) 目标， Caenorhabditis elegans (C. elegans)。

对信使核糖核酸 (mRNA) 的 MicroRNAs 困境在一个特定部分，叫 3' UTR，和知道调控他们。 预测的映射的部分通过在一个生存有机体的发展期间问一个新颖的活体内方法的发展被确认了 3' mRNAs 的 UTR 零件是否驱动管理规定。 他们的研究出现于当前生物的最近问题。

在映射 miRNA 目标，研究小组检查 C. elegans 染色体，完全地排序和一个模型有机体学习染色体的第一动物种类的功能胚胎如何开发。 使用 PicTar，算法被开发在 NYU，研究员预测 C. elegans 基因的 miRNA 功能。 研究员发现 C. elegans miRNAs 目标基因集的三分之一涉及功能。 即看来 miRNAs 能在一个特定生物学过程中运作的控制组基因。 至少 10% 的 C. elegans 基因是预测的 miRNA 目标。

要测试计算预测， NYU 小组开发比较申报人，绿色萤光蛋白质运载的目标 3的表达式 ' 的一个新的 (GFP)活体内分析系统与控制的 UTRs，没有运载这个目标 3' UTRs。 实验室结果广泛比预测确认了特定 3' 的作用 UTRs 在抑制基因表达由这个计算分析，建议 3' UTRs 包含基因管理规定的主要未探测的宇宙。

千位染色体 miRNA 瞄准线虫的预测，或者蛔虫、人和苍蝇从 PicTar 网站 (pictar.bio.nyu.edu) 是可得到和与在 NYU 中心开发的一个新的图形式网络浏览工具被链接为比较功能染色体组的。 这允许 miRNA 目标预测的探险在多种功能基因组数据资源 (gnetbrowse.org) 中。

http://www.nyu.edu