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在酵母的發現對新的信息源關於脫氧核糖核酸故障、維修服務和癌症的開門

Published on March 15, 2006 at 4:18 AM · No Comments

在防護裝置防禦致死的脫氧核糖核酸故障基因網絡的酵母細胞的發現是在變化的人力基因的疾病導致的組合數據庫的創建的第一步,根據研究員在 Jef 導致的瓊斯霍浦金斯大學醫學院。 D. Boeke, Ph.D。

細胞的 3月 10日問題的一個報表, Hopkins 小組描述了為保證在酵母的基因組穩定性是必要的一個基因網絡。 此研究也識別以前未被承認的基因重要為維護脫氧核糖核酸著名的基因的完整性和小說功能。

「很多人力疾病是由是難識別的多基因變化造成的」,說 Boeke,是分子生物學和遺傳學高處理量生物中心教授和主任在 Hopkins 醫學院。

酵母細胞是這種的一個非常好的設計研究,因為 25% 的人力疾病基因在酵母也被找到,根據 Boeke。 所以,在基因此網絡的發現上可能幫助識別結合有害作用原因人力疾病,包括癌症和 neurodegeneration,以及老化的變化。

「我們在酵母發現的交往可能也幫助研究員為發展新選擇這些基因的人力版本適當作為目標,更瞄準了,并且較不含毒物癌症療法」, Boeke 說。

Hopkins 研究的目標是識別,當不同時,在管理基因組完整性扮演冗餘作用在酵母細胞,暫時代替的對基因,當其中一個基因是變化或刪除時。 這樣冗餘保證在管理脫氧核糖核酸穩定性的生物化學的回應網絡的每項任務是實現的, Boeke 注意。

基於從此的數據请學習,調查員能分隔基因基因管理酵母脫氧核糖核酸的穩定性的到 16 個模塊或者迷你路,根據這些基因交往,稱綜合健身或摧毀效能交往。 綜合摧毀效能是二個變化不單個是致死的原因細胞死亡,當結合的現象。 特別地, Hopkins 小組識別在脫氧核糖核酸維修服務,脫氧核糖核酸副本,對氧化重點的制止副本和細胞週期級數由 「檢查點」,以便損壞的脫氧核糖核酸可能經過維修服務和回應介入的 875 個基因中的 4,956 交往必要為減少束縛對并且損壞脫氧核糖核酸高度易反應的分子的細胞內級別。

酵母有大約 6,000 個基因,大約 1,000 對生存是重要的,并且 5,000 不是, Boeke 說。 特別地, 1,000 5,000 個非本質基因是足够重要的,以便酵母遲緩地增長,如果任何他們中的一個是缺少的。 并且 4,000 個其他基因中的任一個可以從這個細胞被刪除,无需干涉細胞的增長。

Hopkins 小組的一個主要目標是確定哪些非本質基因彼此配合,說 Boeke。 5,000 個非本質基因的所有這一類組合在酵母染色體的成對地將要求大約 25 百萬個測試,他添加了。 在這個當前研究中, 74 個基因在與 5,000 個非本質基因的組合,技藝成對地被測試了基本相等對 370,000 個基因對測試。

Hopkins 小組使用了叫作 dSLAM 的技術 (異質接合體微陣列分析的基於二倍體的綜合摧毀效能) 查看 5,000 個不同雙變化的作用對在一個唯一實驗的細胞健身。 此技術,仅將要求 5,000 個測試成對地映射 25 百萬個組合,非常地加速這個工作。

dSLAM 方法是有些像隨機拔出零件收音機發現發生了什麼, Boeke 說。

「與酵母,與收音機,您也許剝去部分 A 或 B 部分和發現這臺收音機仍然運作; 但是,如果您拔出零件和單選彀子您獲悉 A 和 B 可能補嘗彼此的缺勤。 我們拉出酵母的零件是基因,并且我們查找發現發生了什麼,當兩個基因被拔出時」。

dSLAM 技術利用識別基因酵母細胞失蹤的脫氧核糖核酸條形碼。 這是很像使用商業條形碼在存儲迅速識別項目在檢出計數器。 掃描程序在這種情況下是微陣列: 千位網格在拿著脫氧核糖核酸一條唯一 「傳感器」子線符合其中一條形碼玻璃的部分的地點。 設備然後讀傳感器查找配比的條形碼識別與特定變化的特定酵母細胞的微陣列識別。 如果互相補嘗的二個基因被擊倒,酵母細胞彀子和微陣列不記錄該細胞, Boeke 注意。 那意味二個基因彼此配合,他說。

「查找的配合的基因此方法對新的數據的一個非常富有的來源關於脫氧核糖核酸故障,維修服務的將打開這個門,并且人力疾病」, Boeke 補充說。

http://www.hopkinsmedicine.org