Μελετώντας το γονίδιο-έκφρασης προφίλ των ασθενών με καρκίνο του παχέος εντέρου μπορεί να βοηθήσει να προβλέψει την ανταπόκρισή τους στη χημειοθεραπεία

Σε μια μελέτη που δημοσιεύτηκε στο ανοικτής πρόσβασης περιοδικό Genome Biology , οι ερευνητές εντοπίστηκαν στους όγκους του παχέος εντέρου ασθενών με καρκίνο σχεδόν 700 γονίδια των οποίων η έκφραση ήταν διαφορετική μεταξύ των ασθενών που ανταποκρίθηκαν καλά στη συνέχεια να συνδυάζεται χημειοθεραπεία και ασθενείς που ήταν ανθεκτικοί στη θεραπεία.

Τα ευρήματα αυτά θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν στην κλινική πράξη για να συμπληρώσει κλινικών, βιοχημικών και γενετικών δεικτών για την καλύτερη αντιμετώπιση των ασθενών με καρκίνο του παχέος εντέρου.

Μια ερευνητική ομάδα με επικεφαλής τον Sandrine Imbeaud από το CNRS και Pierre and Marie Curie University, Villejuif, Γαλλία, microarrays χρησιμοποιείται για την ανάλυση της έκφρασης των γονιδίων πρότυπα δείγματα από όγκους του παχέος εντέρου και ηπατικές μεταστάσεις που συλλέχθηκαν από 13 ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου. Οι αναλύσεις μικροσυστοιχιών πραγματοποιήθηκαν πριν από τους ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπεία με συνδυασμένη χημειοθεραπεία του φολινικού οξέος, 5-φθοριοουρακίλη και ιρινοτεκάνη.

Imbeaud και οι συνεργάτες του εντόπισαν 679 γονίδια που ήταν διαφορετικά εκφράζεται σε ασθενείς οι οποίοι στη συνέχεια ανταποκρίθηκαν καλά στη χημειοθεραπεία συγκριτικά με τους ασθενείς που ήταν ανθεκτικοί στη θεραπεία. Τα αποτελέσματα επικυρώθηκαν από RT-PCR ανάλυση, η οποία επιβεβαίωσε την έκφραση διαφορική από 22 γονίδια που επιλέγονται από τη λίστα. Τα ευρήματα αυτά επιβεβαιώνονται επίσης από RT-PCR ανάλυση του παχέος εντέρου και του ήπατος δείγματα όγκων που συλλέγονται από δύο επιπλέον ασθενείς.

Οι συγγραφείς ήταν σε θέση να ενσωματώσουν τα πορίσματά τους σε παγκόσμιο επίπεδο και διασυνδεδεμένων δικτύων μοριακή που χαρακτηρίζουν την αντίσταση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου πριν από αυτά είναι εκτεθειμένα σε χημειοθεραπεία. Καταλήγουν στο συμπέρασμα ότι η γνώση αυτών των δικτύων θα μπορούσε ενδεχομένως να χρησιμοποιηθεί για να βελτιώσει τη διάγνωση και τη θεραπεία των ασθενών με καρκίνο του παχέος εντέρου.

http://genomebiology.com/