致命的な犬のウイルスと関連するヒトのウイルスの株を勉強研究者は、犬のウイルスは猫から犬にして、病気の犬から健康な犬にそうすぐに広がることができた理由を決定した。
どの程度の脅威鳥インフルエンザが人間になるのを評価する上で役立つかもしれない情報を - 彼らの研究は、ウイルスが別の種からジャンプすることを許可の重要な分子の因子の新たな理解につながる可能性があります。
の2006年4月号の論文の事前オンライン出版物にウイルス学誌 、ローラShackelton、 HHMIで博士号を取得する前の仲間のオックスフォードの大学イギリスのは、B19のerythrovirusの驚くほど急速な進化、ユビキタスヒトパルボウイルスを調べた。
Shackeltonの最新の論文では、に発表された彼女の以前の研究拡張する全米科学アカデミー紀要肉食動物のパルボウイルス、特に汎白血球減少症ウイルス（FPLV）、30年以上前に犬に交差してネコのウイルスで、2005年を。作品は、彼女の顧問、紙の上で年長の著者である元オックスフォード大学教授エドワードC.ホームズ、と共同で行われていた。ホームズは最近Shackeltonがポスドク研究のために彼を参加するペンシルベニア州立大学、に彼の研究室を移動。
Shackeltonの作品は、アクションの進化のゲノム解析と見なすことができます。 "ウイルスは、化石を残していない"と彼女は説明する。 "あなたが現存しているウイルス配列の違いを比較する場合しかし、あなたは、分子時計を校正することができます。"
ウイルスは宿主細胞の表面上の受容体に結合して細胞の内部に浸透する。バインディングは、キーがロックに収まるのとほぼ同じ方法で行われます。時にはウイルスの外側のコート上のタンパク質は、ウイルスは通常、感染するもの以外の種の細胞上の受容体を一致させるのに十分な変異する。これは、鳥インフルエンザで何が起こったかです。一度新しい種で、ウイルスのいずれかに枯死または保持され、それが新たな種の中でホストからホストに移動できるように変異が追加されます。これは、感染の広がりにつながることができます。
Shackeltonがホストスイッチングのプロセスを理解したい、分子機構のウイルスは別の種からジャンプして採用しています。 "我々は肉食動物のパルボウイルスは、ホストの切り替えに伴う分子の変化を研究するための優れたモデルであることが判明、"彼女はそれが我々は異種間の転送の前後に十分な配列データを持っている非常に少数のウイルスの1つだから"と言った。 。"
コリンR.パリッシュ、コーネル大学でパルボウイルスの専門家、およびライプチヒ大学のウーヴェTruyen、PNAS論文の共同執筆者は、1960年代にさかのぼることパルボウイルス株のゲノム配列を提供する。シーケンスでの作業、Shackeltonは、ウイルスの変異が世代から世代へと送信されている固定になったし、起動時に表示する系統樹を構築するために逆方向にトレース。
ウイルスの進化のダイナミクスを推定するために、彼女とホームズはベイズマルコフ連鎖モンテカルロ（MCMC）アプローチを使用していました。強力な統計ツール、ベイジアンMCMC法は、確率的な関係を調べます。 "このアプローチは、私たちは徹底的にモデルとその分子進化のモードを探索するために、ウイルス配列、およびその分離の日付情報を利用できるように、"Shackeltonは述べています。
彼らの分析は、猫に見られるウイルスのバージョンは100年以上のためにネコの人口に感染していたことが明らかになった。しかし、一度それは、イヌパルボウイルス（CPV - 2）今、FPLV、イヌ科動物に感染し始め、すぐに追加のヌクレオチドの置換、または個々のDNAのビルディングブロックの変更を蓄積し、感染した犬から健康な犬に転送する能力を得た。その急速な変化は、DNAウイルスは急速に変異していないと言う常識を、矛盾。