Badacze studiuje napięcia śmiercionośny z rodziny psów wirus i powiązany ludzki wirus ustalali od chorych psów zdrowi psy i wtedy. dlaczego z rodziny psów wirus był sprawnie rozprzestrzeniać w ten sposób szybko od kotów psy,
Ich studia mogą prowadzić nowy zrozumienie krytyczni cząsteczkowi czynniki które pozwalają wirusy skakać od jeden gatunków inny - informacja która mógł być pomocniczo w oceniać co zagrożenie ptasia grypa jest istoty ludzkie.
W zaliczkowej online publikaci papier w Kwietnia 2006 zagadnieniu czasopismo wirologia, Laura Shackelton, HHMI predoctoral kumpel przy uniwersytetem Oxford w Anglia, egzamininował zaskakująco błyskawiczną ewolucję B19 erythrovirus, wszędobylski ludzki parvovirus.
Shackelton's opóźniony papier przedłużyć jej poprzedzającego badanie publikującego w postępowaniach narodowa akademia nauk w 2005 panleukopenia wirus na carnivore parvoviruses, specyficznie, koci wirus który krzyżował w psy nad 30 rok temu. (FPLV) Praca zrobił we współpracy z jej advisor, poprzedni Oksfordzki profesor Edward C który jest starszym autorem na papierach. Holmes, Holmes ostatnio ruszał się jego laboratorium Pennsylwania stanu uniwersytet, dokąd Shackelton łączy on dla postdoctoral badania.
Shackelton's praca może rozważająca genomic analiza ewolucja w akci. "wirusy no opuszczają skamielin," ona wyjaśniają. Ale ty możesz kalibrować cząsteczkowego zegar. "jeżeli ty porównujesz różnicy między extant wirusowymi sekwencjami,"
Wirusy penetrują wnętrze komórki oprawiać receptory na gospodarz komórki powierzchni. Oprawa zdarza się w ten sam sposobie który dostosowywa w kędziorek klucz. dużo Czasem mutują dosyć dopasowywać receptory na komórkach gatunki proteiny na zewnętrznym żakiecie wirus inny niż ones który zazwyczaj infekuje wirus. To jest co zdarzał się z ptasią grypą. Once w umierają out, konserwują lub dodają mutacje które umożliwiają je ruszać się od gospodarza gospodarz wśród nowych gatunków. nowi gatunki wirus lub To może prowadzić rozlewna infekcja.
Shackelton chciał rozumieć proces zmiana cząsteczkowi mechanizmy wirusy zatrudniają skakać od jeden gatunków inny. "zakładamy carnivore parvoviruses być znakomitym modelem dla studiować cząsteczkowe zmiany które towarzyszą zmianę," ona powiedzieliśmy, "ponieważ ono jest jeden few wirusy bardzo dla których odpowiednich sekwencja dane przed i po gatunku przeniesienie."
Colin R i Uwe Truyen uniwersytet Leipzig. Parrish, parvovirus ekspert przy uniwersytetem cornell, autory na PNAS papierze, pod warunkiem, że genomic sekwencje parvovirus zapasy które datowali z powrotem 1960s. Pracujący z sekwencjami, Shackelton tropił backwards budować filogenetycznego drzewnego seans gdy mutacje w wirusie zostać niezmiennym i zaczynać transmitujący od pokolenia pokolenie.
Po to, aby oszacowywać ewolucyjne dynamika wirus używaliśmy Bayesian Markov łańcuchu Carlo (MCMC) podejście, ona i Holmes. Potężny statystyczny narzędzie Bayesian MCMC metody spojrzenia przy probabilistycznymi związkami. "Ten podejście pozwoli my utylizowywać informację w wirusowych sekwencjach, i ich odosobnienie daty, gruntownie badać modelów i tryby ich cząsteczkowa ewolucja," mówimy Shackelton.
Ich analiza pokazywał że wersja wirus znajdujący w kotach infekował kociej populaci dla sto rok. Ale jak tylko ja zaczynał infekować kły, FPLV, teraz z rodziny psów parvovirus, szybko akumulujących dodatkowych nucleotide podstawienia lub zmiany w indywidualnych DNA elementach, (CPV-2) i zyskujący zdolność przenosić od infekującego psa zdrowy pies. Błyskawiczny tempo ten zmiana zaprzeczał zdrowego rozsądek który mówi, że DNA wirusy no mutują wartko.