Os Pesquisadores que estudam tensões de um vírus canino letal e de um vírus humano relacionado determinaram porque o vírus canino podia espalhar tão rapidamente dos gatos aos cães, e então dos cães doentes aos cães saudáveis.
Seus estudos podem conduzir a uma compreensão nova dos factores moleculars críticos que permitem vírus saltar de uma espécie a outra - a informação que poderia ser útil em avaliar quanto de uma gripe das aves da ameaça é aos seres humanos.
A publicação Adiantado em linha de um papel na introdução De abril de 2006 do Jornal da Virologia, Laura Shackelton, um companheiro predoctoral de HHMI na Universidade de Oxford em Inglaterra, examinou a evolução surpreendentemente rápida B19 do erythrovirus, um parvovirus humano ubíquo.
O papel o mais atrasado de Shackelton estende sua pesquisa precedente publicada nas Continuações da Academia Nacional das Ciências em 2005 sobre os parvoviruses do carnívoro, especificamente vírus do panleukopenia (FPLV), um vírus felino que se cruze sobre em cães sobre 30 anos há. O trabalho foi feito em colaboração com seu conselheiro, o professor anterior Edward C. Holmes de Oxford, que é o autor superior nos papéis. Holmes moveu recentemente seu laboratório para a Universidade Estadual de Pensilvânia, onde Shackelton se juntará lhe para a pesquisa pos-doctoral.
O trabalho de Shackelton pode ser considerado uma análise genomic da evolução na acção. Os “Vírus não saem de fósseis,” ela explicam. “Mas se você compara as diferenças entre seqüências virais extant, você pode calibrar o pulso de disparo molecular.”
Os Vírus penetram o interior das pilhas ligando aos receptors na superfície de pilha de anfitrião. O emperramento ocorre aproximadamente da mesma maneira que ajustes de uma chave em um fechamento. Às Vezes as proteínas no revestimento exterior de um vírus transformam bastante para combinar os receptors nas pilhas das espécies diferentes de umas que o vírus contamina geralmente. Este é o que aconteceu com gripe aviária. Uma Vez em uma espécie nova, o vírus morre para fora ou é preservado e adiciona as mutações que o permitem de se mover do anfitrião para o anfitrião dentro da espécie nova. Isto pode conduzir a infecção difundida.
Shackelton quis compreender o processo de anfitrião-interruptor, os mecanismos que moleculars os vírus empregam para saltar de uma espécie a outra. “Nós encontramos os parvoviruses do carnívoro para ser um modelo excelente para estudar as mudanças moleculars que acompanham o anfitrião-interruptor,” ela dissemos, “porque é um muito de poucos vírus para que nós temos dados adequados da seqüência antes e depois de que transferência das cruz-espécies.”
Colin R. Parrish, um perito do parvovirus na Universidade de Cornell, e Uwe Truyen da Universidade de Leipzig, co-autores no papel de PNAS, desde que as seqüências genomic dos estoques do parvovirus que dataram dos anos 60. Trabalhando com as seqüências, Shackelton seguiu para trás para construir uma exibição filogenética da árvore quando as mutações no vírus se transformaram ser transmitido fixo e começado de geração em geração.
A fim calcular a dinâmica evolucionária do vírus, e Holmes usaram uma aproximação Bayesian de Carlo da Corrente-Monte (MCMC) de Markov. Uma ferramenta estatística poderosa, o método MCMC Bayesian olha relacionamentos probabilísticas. “Esta aproximação permite que nós utilizem a informação nas seqüências virais, e suas tâmaras do isolamento, para explorar completamente modelos e modos de sua evolução molecular,” diz Shackelton.
Sua análise mostrou que a versão do vírus encontrado nos gatos tem contaminado a população felino por mais de cem anos. Mas uma vez que começou a contaminar caninos, FPLV, agora o parvovirus canino (CPV-2), substituições adicionais rapidamente acumuladas do nucleotide, ou mudanças em blocos de apartamentos individuais do ADN, e ganhado a capacidade para transferir de um cão contaminado a um cão saudável. O ritmo rápido dessa mudança contradisse a sabedoria popular, que diz que os vírus do ADN não se transformam ràpida.