Исследователя изучая напряжения летального собачьего вируса и родственного людского вируса определяли почему собачий вирус мог распространить настолько быстро от котов к собакам, и после этого от больных собак к здоровым собакам.
Их изучения могут вести к новому вниканию критических молекулярных факторов которые позволяют вирусы поскакать от одного вида к другим - информация которая смогла быть полезна в определять насколько из птичего гриппа угрозой к людям.
Заранее он-лайн издание бумаги в вопросе Апреля 2006 Журнала Вирусологии, Лауры Shackelton, собрата HHMI predoctoral на Университете Оксфорда в Англии, рассмотрело удивительно быстрое развитие B19 erythrovirus, вездесущее людское parvovirus.
Бумага Shackelton самая последняя расширяет ее предыдущее исследование опубликованное в Продолжениях Государственной Академии Наук в 2005 на parvoviruses мясоеда, специфически вирус panleukopenia (FPLV), кошачий вирус который пересек сверх в собак над 30 летами тому назад. Работа была сделана в сотрудничестве с ее советником, бывшим профессором Эдвардом C. Holmes Оксфорда, который старший автор на бумагах. Holmes недавно двинуло его лабораторию к Государственному Университету Пенсильвания, где Shackelton соединит его для postdoctoral исследования.
Работу Shackelton можно рассматривать genomic анализом развития в действии. «Вирусы не покидают ископаемые,» она объясняют. «Но если вы сравниваете разницы между extant вирусными последовательностями, то вы можете откалибрировать молекулярные часы.»
Вирусы прорезывают интерьер клеток путем связывать к приемным устройствам на поверхности ведущей ячейки. Вязка происходит в много такой же путь что пригонки ключа в замок. Иногда протеины на наружном пальто вируса видоизменяют достаточно для того чтобы соответствовать приемным устройствам на клетках видов за исключением одних которые вирус обычно заражает. Это что случалось с птичий гриппом. Раз в новом виде, вирус или умирает вне или сохраняют и добавляет перегласовки которые позволяют он двинуть от хозяина к хозяину в пределах нового вида. Это может вести к широко распространённый инфекции.
Shackelton хотело понять процесс хозяин-переключения, молекулярные механизмы вирусы используют для того чтобы поскакать от одного вида к другим. «Мы нашли parvoviruses мясоеда для того чтобы быть превосходной моделью для изучать молекулярные изменения которые сопровождают хозяин-переключение,» она сказали, «потому что оно один из очень немногих вирусов для которых мы имеем адекватние данные по последовательности прежде и после переход крест-видов.»
Colin R. Parrish, специалист parvovirus на Университете Корнеллаа, и Uwe Truyen Университета Лейпциг, соавторов на бумаге PNAS, при условии genomic последовательности штоков parvovirus которые датировали назад к 1960s. Работающ с последовательностями, Shackelton трассировало ОН назад для того чтобы построить филогенетический показ дерева когда перегласовки в вирусе стали фикчированным и начатым быть переданным от поколения к поколению.
Для того чтобы оценить постепеновскую динамику вируса, она и Holmes использовали Bayesian Markov подход к Carlo (MCMC) Цепи-Monte. Мощный статистически инструмент, Bayesian метод MCMC смотрит вероятностные отношения. «Этот подход позволяет нам использовать информацию в вирусных последовательностях, и их даты изоляции, тщательно исследовать модели и режимы их молекулярного развития,» говорит Shackelton.
Их анализ показал что версия вируса найденного в котах заражала кошачую населенность на сверх 100 лет. Но как только он начал заражать canines, FPLV, теперь собачье parvovirus (CPV-2), быстро аккумулированные дополнительные замещения нуклеотида, или изменения в индивидуальных строительных блоках ДНА, и приобретено способности перенести от зараженной собаки к здоровой собаке. Быстрая побежка того изменения противоречила житейской мудрости, которая говорит что вирусы ДНА не видоизменяют быстро.