允许病毒从一个种类跳到另一个对重要分子系数的新的了解

学习致死的似犬病毒和相关人力病毒的亚型的研究员从病的狗确定了似犬病毒为什么能那么迅速分布从猫到狗，然后到健康狗。

他们的研究可能导致允许病毒从一个种类跳到另一个对重要分子系数的新的了解 - 可能是有用的在估计的信息多少威胁禽流感是给人。

事先一份文件的在线发行在病毒学日记帐，劳拉 Shackelton，牛津大学的一名 HHMI predoctoral 研究员的 4月 2006 问题的在英国，检查 B19 erythrovirus，一普遍存在的人力 parvovirus 的惊奇地迅速演变。

在 2005年 Shackelton 的晚报扩大在国家科学院的行动发布的她的早先研究对食肉动物 parvoviruses，特别地 panleukopenia 病毒 (FPLV)，克服到狗在 30 年期间前的似猫的病毒。 这个工作被完成了与她的顾问，前牛津教授爱德华 C. Holmes 合作，是文件的高级作者。 Holmes 最近搬到他的实验室宾夕法尼亚州立大学， Shackelton 为博士后的研究将连接他。

Shackelton 的工作可以被认为对在活动的演变的一个基因组分析。 “病毒不离开化石”，她解释。 “但是，如果您比较现存病毒顺序之间的区别，您能校准分子时钟”。

病毒通过束缚击穿细胞内部到在寄主细胞的表面的感受器官。 捆绑在相似情况下发生关键字适应到锁定。 有时在病毒的外面外套的蛋白质改变足够符合在种类细胞的感受器官除病毒通常传染的一个之外。 这是什么发生与鸟流感。 一次在一个新的种类，病毒灭绝或保留并且添加使它从主机移动到在新的种类内的主机的变化。 这可能导致普遍传染。

Shackelton 要了解主机切换的进程，病毒使用从一个种类跳到另一个的分子结构。 “我们查找食肉动物 parvoviruses 是学习的随附于主机切换的分子更改一个非常好的设计”，她说， “因为它是我们有足够的顺序数据在交叉形式调用前后非常少量病毒的之一”。

Colin 在莱比锡， PNAS 文件的共同执笔者大学的康奈尔大学的 R. Parrish、 parvovirus 专家和 Uwe Truyen，假设的 parvovirus 股票基因组顺序追溯到 20 世纪 60 年代。 当在病毒的变化成为固定和开始的一代代，传输与顺序一起使用， Shackelton 向后跟踪修建一个种系发生的结构树陈列。

为了估计病毒的演变动力，她和 Holmes 使用一个贝叶斯马尔可夫链子Monte 克罗 (MCMC)途径。 一个强大的统计工具，这个贝叶斯 MCMC 方法查看机率关系。 “此途径允许我们使用在病毒顺序的信息，并且他们的隔离日期，十分地测试他们的分子演变设计和模式”， Shackelton 说。

他们的分析向显示在猫找到的病毒的版本传染似猫的人口一百年。 但是，一旦它开始传染犬、 FPLV、现在似犬 parvovirus (CPV-2)，迅速被累计的另外的核苷酸替换件或者变化在各自的脱氧核糖核酸构件上和获取能力从一条被传染的狗调用到一条健康狗。 该更改的高速抗辩了传统观念，说脱氧核糖核酸病毒不迅速地改变。

Parvoviruses 是包装脱氧核糖核酸一条子线在防护壳的单一被中断的脱氧核糖核酸病毒，称蛋白质 capsid。 一次在寄主细胞，此子线作为这块模板和病毒复制品通过一件双股的半成品。 更加公用的双股的脱氧核糖核酸病毒需要安排卷起的螺旋解开为了复制。

“因为他们是脱氧核糖核酸病毒和复制品与主机细胞机械，假设，我们应该更看到变化的费率与那些他们的主机和其他脱氧核糖核酸病毒相似”，说 Shackelton。 “我们看到顺序大小区别，费率典型核糖核酸病毒”。

吸引，她然后下决心发现此现象是否是典型的整个 Parvoviridae 系列。 在病毒学日记帐上报告的这个研究，她检查人力 B19 erythrovirus，传染骨髓祖先细胞，并且可以与重点复杂化相关的 parvovirus。 她选择了它，因为它遥远地与 CPV-2 有关，用不同的传染途径。 这个分析显示了同一个惊奇地迅速变化率。 “脱氧核糖核酸和核糖核酸病毒之间的区别不是一样简单的她和 Holmes 现在确信，象我们认为它是。 有可能延伸到所有单一子线病毒的事唯一关于 parvoviruses”。

在实验他们的下系列，与 Parrish 的组一起，科学家将工作了解更多关于该唯一性和了解其根本原因。 它是在了解可能帮助所有病毒的工作，包括鸟流感。

“越多我们知道种类调用活动，并且影响核苷酸替换件费率的系数，越好”， Shackelton 说，也感兴趣对对病毒爆发的公共策略回应， “此工作增加我们的关于什么分子更改的知识需要为种类调用，更改的更改或组合是重要部分，并且他们如何发生频繁地发生”。

http://www.hhmi.org