Att studera för Forskare anstränger av en dödlig hund- virus, och en släkt människavirus har beslutsamt, därför den hund- viruset var kompetent till spridning så snabbt från katter till hundkapplöpning, och därefter från sjuk hundkapplöpning till sund hundkapplöpning.
Deras studier kan leda till en ny överenskommelse av det kritiska molekylärt dela upp i faktorer att tillståndvirus för att hoppa från art en till another - information som kunde vara hjälpsam, i att bedöma, hur mycket av en avian influensa för hot är till människor.
I förskott utfärdar den on-line publikationen av ett pappers- i April 2006 av Föra Journal över av Virology, Laura Shackelton, en predoctoral kamrat för HHMI på Universitetar av Oxford i England, undersökte förvånansvärt forevolutionen av B19 erythrovirusen, en allestädes närvarande människaparvovirus.
Shackeltons fördjupa senaste pappers- henne föregående forskning som publiceras i Förfarandena av MedborgareAkademin av Vetenskaper i 2005 på carnivoreparvovirusesna, specifikt panleukopeniaviruset (FPLV), en feline virus som korsade över in i hundkapplöpning över 30 år sedan. Arbetet gjordes i samarbete med henne rådgivaren, den tidigare Oxford professorn Edward C. Holmes, som är den höga författare på legitimationshandlingar. Holmes som för en tid sedan är rörd hans laboratorium till den Pennsylvania Delstatsuniversiteten, var Shackelton ska, sammanfogar honom för postdoctoral forskning.
Shackeltons arbete kan vara ansett en genomic analys av evolution i handling. ”Lämnar Virus inte fossil,” henne förklarar. ”Men, om du jämför skillnaderna mellan ännu existerande virus-, ordnar, dig kan kalibrera det molekylärt tar tid på.”,
Virus tränger igenom inre av celler vid bandet till receptors på vara värdcellen ytbehandlar. Bandet uppstår i mycket samma långt den nyckel- passformar in i en låsa. Ibland täcker proteiner på det yttre av en virus muterar nog för att matcha receptorsna på cellerna av art annan än en som viruset smittar vanligt. Detta är vad har händt med avian influensa. En Gång i dör bevaras tillfogar den nya arten, viruset endera ut eller och mutationar som möjliggör den till flyttningen från varar värd för att vara värd inom den nya arten. Detta kan leda till utbredd infektion.
Shackelton önskade att förstå det processaa av vara värd-växling, den molekylära mekanismen som virus använder för att hoppa från art en till another. ”Grundar Vi carnivoren som parvoviruses som är ett utmärkt, modellerar för att studera de molekylära ändringarna, som medföljer vara värd-växling,” henne sade, ”, därför att den är en av de very få virusen som vi har adekvat att ordna för data för, och, efter denart överföringen.”,
Colin R. Parrish, en parvovirus som är sakkunnig på den Cornell Universitetar och Uwe Truyen av Universitetar av Leipzig, co-författare på PNASEN, skyler över brister, provided det genomic ordnar av parvovirus lagerför att daterad baksida till 60-tal. Arbetet med ordnar, spårade Shackelton tillbaka till tankeskapelsen en phylogenetic treevisning, då mutationar i viruset blev fixad och startad överföring från utvecklingen till utvecklingen.
För att bedömningen den evolutions- dynamiken av viruset använde hon och Holmes ett Bayesian Markov Kedjar-Monte Carlo (MCMC) att närma sig. Ett kraftigt statistiskt bearbetar, de Bayesian looksna för metod MCMC på probabilistic förhållanden. ”Att närma sig Detta låter oss använda informationen i det virus- ordnar, och deras isolering daterar, grundligt för att undersöka modellerar och funktionslägen av deras molekylära evolution,” något att säga Shackelton.