En analyse av H5N1 influensa prøver i Sørøst-Asia viser ikke bare hvordan de to stammene som har forårsaket sykdom hos mennesker er i slekt, men også at de tilhører to forskjellige, distinkte genetiske undergrupper. Forskere fra Centers for Disease Control and Prevention rapportere sine funn på den internasjonale konferansen om Emerging Infectious Diseases.
"Som viruset fortsetter sin geografiske ekspansjon, er det også gjennomgår genetisk mangfold ekspansjon," sier Rebecca Garten, en forsker på studien. "Tilbake i 2003 hadde vi bare en genetisk distinkt bestand av H5N1 med potensial til å forårsake en menneskelig pandemi, nå har vi to."
Garten og hennes kolleger gjennomført en fylogenetisk analyse av over 300 H5N1-viruset prøver tatt fra både aviær og menneskelige kilder fra 2003 gjennom sommeren 2005. De korrelert den genetiske sammensetningen av virus til de fysiske egenskapene til virus, inkludert overflate proteiner og receptor områder, for å avgjøre hvor hver virus bør plasseres på H5N1 slektstreet.
Ikke alle H5N1 virus er genetisk like. Gjennom årene har forskerne identifisert ulike genetiske grupper kalt genotyper.
Flertallet av virus, inkludert alle de menneskelige tilfeller, tilhørte genotype Z. Det var også lite antall virus isolert fra aviær bestander som var genotype V eller W eller nylig identifisert genotype G.
Det er der likheten mellom de to menneskelige stammer endte. Tidligere forskning publisert av Verdens helseorganisasjon har klassifisert videre genotype Z inn i undergrupper kalt clades. I 2003 og 2004 ble clade 1 virus hovedansvarlig for utbrudd, inkludert alle infeksjoner i mennesker, i Viet Nam, Kambodsja og Thailand.