De Wetenschappers bij St. Jude Children's het Ziekenhuis van het Onderzoek hebben onderzoekers rond de wereld vrije toegang tot een krachtig hulpmiddel gegeven om hersenenontwikkeling te bestuderen.
Het op Internet-Gebaseerde hulpmiddel, genoemd de Kaart van de Uitdrukking van het Gen van muisHersenen (BGEM), is één van de grootste kaarten van de genuitdrukking van een orgaan dat ooit, volgens de St. Jude onderzoekers wordt ontwikkeld. Zij zeggen de kaart waarschijnlijk wetenschappers zal helpen de genetische oorsprong van hersenenkanker ontdekken, die ontwikkeling van nieuwe drugs kon verzenden om hen te behandelen.
Het voortdurende bijwerken en de voltooiing van de Bgem- Website zullen voor wetenschappers essentieel zijn. Meer dan wordt de helft ongeveer 25.000 genen in de muis verondersteld om in de ontwikkeling en de functie van het zenuwstelsel worden geïmpliceerd, maar de wetenschappers hebben de functie van slechts 30 percent van hen bepaald. Vele hersenenwanorde, zoals tumors en sommige psychiatrische ziekten, wordt ook verondersteld om door genveranderingen worden veroorzaakt die zich tijdens ontwikkeling van dit complexe orgaan voordoen.
Een rapport over de ontwikkeling en de beschikbaarheid van BGEM lijkt in 28 Maart kwestie van Biologie PLoS. De Website is http://www.stjudebgem.org/
De gelijkenis van de muis en de menselijke hersenen maken deze kaart aan onderzoekers nuttig die de ontwikkeling van de menselijke hersenen en de oorsprong van hersenentumors van genveranderingen, volgens Tom Curran, Ph.D., co-chair van OntwikkelingsNeurobiologie bij St. Jude bestuderen. „BGEM vertegenwoordigt een nieuwe strategie want ruilend informatie onder onderzoekers die ons begrip van het menselijke zenuwstelsel zullen versnellen,“ hij zei. „Ik voorzie een tijd wanneer de onderzoekers bepaalde studies zullen kunnen doen om hypothesen te bevestigen gebruikend een computerinterface die onze gegevens met veel andere soorten geninformatie verbindt, zonder de behoefte om in een regelmatig laboratorium te gaan.“
BGEM is het groeien, encyclopedische inzameling van tientallen duizenden beelden zoals die door een microscoop wordt gezien. De beelden worden verkregen op verschillende tijdpunten en tonen waar en wanneer de specifieke genen bij elk van vier ontwikkelingsstadia worden uitgedrukt. De uitdrukking van het Gen is zichtbaar omdat de speciale markeringen genoemd sondes aan boodschappersRNA (mRNA) binden -- de gedecodeerde vorm van het gen -- en geef een signaal vrij dat kan worden gezien gebruikend een speciale microscoop. De uitdrukking van het Gen verwijst naar de productie van mRNA, die de blauwdruk het celgebruik wordt die de proteïne te maken voor door dat gen wordt gecodeerd.
BGEM verbindt deze beelden met de meest bijgewerkte informatie over die genen, zoals hun functie, plaats op chromosomen en de nauwkeurige opeenvolging van DNA. BGEM verzamelt deze informatie door directe links aan de wetenschappelijke gegevensbestanden PubMed, LocusLink, Unigene en het Consortium van de Ontologie van het Gen, dat op het Nationale Centrum voor de Informatie van de Biotechnologie in de Nationale Bibliotheek van Geneeskunde wordt gehuisvest. Beurtelings, worden de beelden BGEM gebruikt door de Atlas van het Zenuwstelsel van de Uitdrukking van het Gen (GENSAT), die tot doel heeft om de uitdrukking van alle genen in het zenuwstelsel te documenteren. GENSAT wordt gesteund door het Nationale Instituut van Neurologische Ziekten en Slag (NINDS), en een vennootschap van 14 instituten en centra van de Nationale Instituten van Gezondheid (NIH), die een consortium hebben gevormd om doorbraken te versnellen in het begrip van het zenuwstelsel. St. Jude ondernam het Bgem- project onder toeleveringscontract van Universiteit Rockefeller (New York) namens NINDS.
Een „onderzoeker die een eerder niet erkend gen ontdekt dat tijdens hersenenontwikkeling wordt uitgedrukt kan snel bepalen hoe het in de algemene regeling van hersenenontwikkeling,“ bovengenoemde Craig Brumwell, Doctoraat, de manager GENSAT in St. Jude Developmental Neurobiology past. „BGEM helpt onderzoekersskip over veel van de slaafsheid van het blootleggen van informatie van de literatuur of van andere gegevensbestanden.“
BGEM bevat reeds gedetailleerde informatie en beelden van de uitdrukking van honderden genen die zeer belangrijke rollen spelen die hersenenontwikkeling leiden, de uitdrukking van andere genen controleren, eiwitproductie leiden en molecules vervoeren binnen de cel.