鼠标脑子在圣茱迪 - 为学习脑子发展的强大的新工具的基因表达映射

圣茱迪儿童的研究医院的科学家产生调查员环球对强大的工具的自由存取为学习脑子发展。

基于互联网的工具，称鼠标脑子基因表达映射 (BGEM)，是其中一根据圣茱迪研究员被开发的，机构的最大的基因表达映射。 他们说映射可能将帮助科学家发现脑癌的基因始发地，可能加速新颖的药物发展对待他们。

BGEM 网站的连续的更新和完成对科学家将是关键的。 更多比大约 25,000 个基因的一半在这个鼠标的在神经系统的发展和功能认为介入，但是科学家只确定了 30% 的功能的他们。 许多脑子紊乱，例如肿瘤和一些精神病学的疾病，也应该由在此复杂机构的发展期间，出现的基因突变造成。

关于 BGEM 的发展和可用性的一个报表发表于 PLoS 生物的 3月 28日问题。 网站是 http://www.stjudebgem.org/

这个鼠标的相似性和人脑使此映射有用对根据汤姆 Curran 学习人脑发展和脑瘤的始发地从基因突变的， Ph.D 的研究员。，发展神经生物学的联合主席在圣茱迪的。 “BGEM 表示交换的信息一个新的方法在将加速对人力神经系统的我们的了解的研究员中”，他说。 “我预见时候，当研究员能执行某些研究确认假说使用与许多其他基因信息链接我们的数据的计算机界面，没有需要进入一个正常实验室”。

BGEM 是生长，数万个图象的广博收藏如进行下去显微镜。 图象得到在明显的时间点，并且显示特定基因何时何地表示在四个发展阶段中的每一个。 基因表达是可视的，因为称探测的特殊标签束缚对信使核糖核酸 (mRNA) -- 基因的被解码的表单 -- 并且请发行使用一个特殊显微镜，能被看到的信号。 基因表达是指 mRNA 的生产，成为这张图纸这个细胞使用做蛋白质对由该基因编码。

BGEM 与关于那些基因的最最新的信息链接这些图象，例如他们的功能、地点染色体的和确切的脱氧核糖核酸顺序。 BGEM 通过直接链接收集此信息对科学数据库 PubMed、 LocusLink、 Unigene 和基因本体论财团，被安置在美国国家生物技术信息中心在医学国立图书馆。 反过来，基因表达神经系统地图集使用 BGEM 图象 (GENSAT)，寻求提供所有基因表达式在神经系统的。 GENSAT 由神经病和中风 (NINDS) 国家学院和的 14 个学院和中心合伙企业支持国家卫生研究所 (NIH)，组成财团加速在了解神经系统的突破。 St. 茱迪执行 BGEM 项目在从洛克菲勒大学 (纽约) 的分包合同下代表 NINDS。

“发现一个以前未被承认的基因表示在脑子发展期间的研究员能迅速地确定它如何适合到脑子发展整体模式”，在圣茱迪发展神经生物学方面 GENSAT 经理说克雷格 Brumwell， PhD。 “BGEM 帮助研究员跳过在许多发现信息苦工从这个文件或从其他数据库”。

BGEM 已经包含的数百表达式的详细信息和图象扮演处理脑子发展，控制其他基因，引导的蛋白质生产表达式和运输在这个细胞内的关键角色分子基因。

BGEM 的成功的一个关键部分是发展在圣的分析复杂生物资料的学科软件茱迪定期地搜索科学数据库对于关于与脑子发展被链接的基因的新的信息，说 Perdeep Mehta、 Ph.D。，组领导先锋在分析复杂生物资料的学科方面在圣茱迪的分析复杂生物资料的学科 Hartwell 中心和生物工艺学。 分析复杂生物资料的学科是对计算机、软件和其他技术的使用收集，组织，格式化和使用很多生物信息。 “我们的能力与关于那些基因的信息链接基因表达模式的图象在其他数据库中增加每个新的基因发现的值”， Mehta 说。

多个研究的此综合化处理，并且 BGEM 的情报是关键的对圣茱迪研究的成功人脑肿瘤的起源对于儿童。 这个小组使用称微阵列分析的一个技术学习在人脑肿瘤范例的基因表达模式称室鼓膜瘤的。 通过在人力室鼓膜瘤的基因表达模式与那些比较在 BGEM 提供的正常开发的鼠标神经系统，圣茱迪调查员显示出，特定脑细胞，称辐形神经胶质细胞，可能提升了室鼓膜瘤。

“我们的演示出现用这个中央神经系统的不同的地区的相同室鼓膜瘤是明显的疾病，因为他们从不同的干细胞出现是重要答案”，理查 Gilbertson， M.D.， Ph.D 说。，一个报表的高级作者关于出现于癌细胞的 10月 2005 问题的此工作的。 “这建议应该设计处理杀害基础癌症干细胞人口。 如果您杀害组成批量项目货签的仅细胞这个肿瘤，这个疾病可能将返回，因为您未消灭这个肿瘤的来源。 进一步，对恶性和正常开发的组织的我们的比较分析提供映射固定的肿瘤干细胞一个新的方法。 BGEM 的摊缴是无价的对我们的工作和可能导致将改进脑癌的处理的重要发现”。

http://www.stjude.org/