鼠標腦子在聖茱迪 - 為學習腦子發展的強大的新工具的基因表達映射

聖茱迪兒童的研究醫院的科學家產生調查員環球對強大的工具的自由存取為學習腦子發展。

基於互聯網的工具，稱鼠標腦子基因表達映射 (BGEM)，是其中一根據聖茱迪研究員被開發的，機構的最大的基因表達映射。 他們說映射可能將幫助科學家發現腦癌的基因始發地，可能加速新穎的藥物發展對待他們。

BGEM 網站的連續的更新和完成對科學家將是關鍵的。 更多比大約 25,000 個基因的一半在這個鼠標的在神經系統的發展和功能認為介入，但是科學家只確定了 30% 的功能的他們。 許多腦子紊亂，例如腫瘤和一些精神病學的疾病，也應該由在此複雜機構的發展期間，出現的基因突變造成。

關於 BGEM 的發展和可用性的一個報表發表於 PLoS 生物的 3月 28日問題。 網站是 http://www.stjudebgem.org/

這個鼠標的相似性和人腦使此映射有用對根據湯姆 Curran 學習人腦發展和腦瘤的始發地從基因突變的， Ph.D 的研究員。，發展神經生物學的聯合主席在聖茱迪的。 「BGEM 表示交換的信息一個新的方法在將加速對人力神經系統的我們的瞭解的研究員中」，他說。 「我預見時候，當研究員能執行某些研究確認假說使用與許多种其他基因信息鏈接我們的數據的計算機界面，沒有需要進入一個正常實驗室」。

BGEM 是生長，數萬個圖像的廣博收藏如進行下去顯微鏡。 圖像得到在明顯的時間點，并且顯示特定基因何時何地表示在四個發展階段中的每一個。 基因表達是可視的，因為稱探測的特殊標籤束縛對信使核糖核酸 (mRNA) -- 基因的被解碼的表單 -- 并且请發行使用一個特殊顯微鏡，能被看到的信號。 基因表達是指 mRNA 的生產，成為這張圖紙這個細胞使用做蛋白質對由該基因編碼。

BGEM 與關於那些基因的最最新的信息鏈接這些圖像，例如他們的功能、地點染色體的和確切的脫氧核糖核酸順序。 BGEM 通過直接鏈接收集此信息對科學數據庫 PubMed、 LocusLink、 Unigene 和基因本體論財團，被安置在美國國家生物技術信息中心在醫學國立圖書館。 反過來，基因表達神經系統地圖集使用 BGEM 圖像 (GENSAT)，尋求提供所有基因表達式在神經系統的。 GENSAT 由神經病和中風 (NINDS) 國家學院和的 14 個學院和中心合夥企業支持國家衛生研究所 (NIH)，組成財團加速在瞭解神經系統的突破。 St. 茱迪執行 BGEM 項目在從洛克菲勒大學 (紐約) 的分包合同下代表 NINDS。

「發現一個以前未被承認的基因表示在腦子發展期間的研究員能迅速地確定它如何適合到腦子發展整體模式」，在聖茱迪發展神經生物學方面 GENSAT 經理說克雷格 Brumwell， PhD。 「BGEM 幫助研究員跳過在許多發現信息苦工從這個文件或從其他數據庫」。

BGEM 已經包含的數百表達式的詳細信息和圖像扮演處理腦子發展，控制其他基因，引導的蛋白質生產表達式和運輸在這個細胞內的關鍵角色分子基因。

BGEM 的成功的一個關鍵部分是發展在聖的分析複雜生物資料的學科軟件茱迪定期地搜索科學數據庫對於關於與腦子發展被鏈接的基因的新的信息，說 Perdeep Mehta、 Ph.D。，組領導先鋒在分析複雜生物資料的學科方面在聖茱迪的分析複雜生物資料的學科 Hartwell 中心和生物工藝學。 分析複雜生物資料的學科是對計算機、軟件和其他技術的使用收集，組織，格式化和使用很多生物信息。 「我們的能力與關於那些基因的信息鏈接基因表達模式的圖像在其他數據庫中增加每個新的基因發現的值」， Mehta 說。

多個研究的此綜合化處理，并且 BGEM 的情報是關鍵的對聖茱迪研究的成功人腦腫瘤的起源對於兒童。 這個小組使用稱微陣列分析的一個技術學習在人腦腫瘤範例的基因表達模式稱室鼓膜瘤的。 通過在人力室鼓膜瘤的基因表達模式與那些比較在 BGEM 提供的正常開發的鼠標神經系統，聖茱迪調查員顯示出，特定腦細胞，稱輻形神經膠質細胞，可能提升了室鼓膜瘤。

「我們的演示出現用這個中央神經系統的不同的地區的相同室鼓膜瘤是明顯的疾病，因為他們從不同的乾細胞出現是重要答案」，理查 Gilbertson， M.D.， Ph.D 說。，一個報表的高級作者關於出現於癌細胞的 10月 2005 問題的此工作的。 「這建議應該設計處理殺害基礎癌症乾細胞人口。 如果您殺害組成批量項目貨簽的仅細胞這個腫瘤，這個疾病可能將返回，因為您未消滅這個腫瘤的來源。 進一步，對惡性和正常開發的組織的我們的比較分析提供映射固定的腫瘤乾細胞一個新的方法。 BGEM 的攤繳是無價的對我們的工作和可能導致將改進腦癌的處理的重要發現」。

http://www.stjude.org/