I batteri più semplici hanno bisogno quasi due volte di altrettanti geni di sopravvivere a che gli scienziati in primo luogo creduti, secondo la nuova ricerca pubblicata in Natura (30 marzo 2006).
I Batteri sono alcuni dei moduli più semplici di vita e sono stati studiati dagli scienziati che provano ad identificare la più piccola raccolta dei geni - o genoma minimo - che è necessario per vita di mantenimento.
Gli scienziati hanno fatto Tradizionalmente questa mediante la rimozione, o il ` tramortire', una serie di diversi geni da un genoma batterico per vedere che effetto questo ha sulla sua capacità di sopravvivere a.
Possono poi arguire quali geni sono essenziali all'organismo e quale non sono, risolvere che sono necessari per il genoma minimo.
Tuttavia questo tramorte l'approccio scorrettamente rimuove molti dei geni che sono essenziali alla sopravvivenza dei batteri, secondo i ricercatori da Heidelberg (Germania), da Manchester (REGNO UNITO), da Budapest (Ungheria) e dal Bagno (REGNO UNITO).
I ricercatori hanno fatto questa scoperta dopo avere sviluppato un nuovo approccio alla modellistica del genoma che, data la cronologia evolutiva e la conoscenza dell'organismo del suo ambiente circostante, li permette di predire quale i geni il genoma di un batterio dovrebbero contenere.
“I tentativi Precedenti di risolvere il genoma minimo hanno contato sulla cancellazione dei geni diversi per arguire quali geni sono essenziali per vita di mantenimento,„ hanno detto il Professor Laurence Hurst dal Dipartimento di Biologia e della Biochimica all'Università di Bagno.
“Questo tramorte le mancanze di approccio il fatto che ci sono itinerari genetici alternativi, o vie, alla produzione dello stesso prodotto cellulare.
“Quando tramortite un gene, il genoma può compensare usando un gene alternativo.
“Ma quando ripetete l'esperimento di tramortire cancellando l'alternativa, il genoma può ritornare al gene originale invece.
“Facendo Uso dell'approccio di espulsione potreste arguire che entrambi i geni sono usabili dal genoma perché non sembra essere effetto deleterio in entrambi gli esperimenti.
“Infatti, perché ci sono vie alternative allo stesso prodotto, rimuovendo l'uno o l'altro dei geni rendete l'altro essenziale per la sopravvivenza; ogni eliminazione del gene diminuisce lo spazio disponibile per ulteriore riduzione del genoma.
„ Compreso queste vie alternative nel genoma minimo quasi raddoppia la sua dimensione.„
I ricercatori hanno sviluppato un modo di predizione del contenuto batterico del genoma facendo uso di due batteri che si sono evoluti da E.coli.
Insetti interni in tensione di Wigglesworthia e di Buchnera in una relazione simbiotica dove forniscono le molecole essenziali per i loro host in cambio degli alimenti di base essenziali.
Dall'evoluzione da E.coli, i genoma di Wigglesworthia e di Buchnera hanno perso alcuni dei geni di che avrebbero bisogno altrimenti per la sopravvivenza.
Facendo Uso del modello elaborato dal calcolatore e della conoscenza dell'ecologia di oggi dei batteri i ricercatori potevano modellare questo trattamento di perdita del gene.