細菌は簡単な形式の生命のいくつかで、遺伝子の最も小さいコレクションを識別することを試みている科学者によって調査されました - または維持の生命の間必要である最小のゲノム。
従来科学者は、または ` を除去によってどんな効果をこれが存続する機能にもたらすか見るために」たたくこれ細菌のゲノムからの一連の個々の遺伝子しました。
彼らは解決するためかそれからどの遺伝子が有機体に必要であり、最小のゲノムのために必要であるどれがないか推論してもいいです。
ただしこのアプローチを不正確に除去しますハイデルベルク (ドイツ)、マンチェスター (イギリス)、ブダペスト (ハンガリー) および Bath (イギリス) からの研究者に従って細菌の存続に必要、である遺伝子の多数をたたいて下さい。
研究者は、有機体の周囲の環境の発展の歴史そして知識が模倣に新しいアプローチを開発した後この発見を、それらが遺伝子が細菌のゲノムべきであるかどのか予測するように含むするあるゲノムのしました。
「最小のゲノムを解決する前の試みどの遺伝子が維持の生命の間必要であるか推論するために個々の遺伝子の削除に Bath の大学で」、は言いましたローレンス Hurst 生物学および生物化学の部門からの教授を頼りました。
「この同じ細胞製品の生産にアプローチの失敗を代わりとなる遺伝のルートがある、またはパス、ノックアウトして下さいという事実。
「1 つの遺伝子をノックアウトするとき、ゲノムは代わりとなる遺伝子の使用によって償うことができます。
「しかしノックを繰り返すとき、ゲノムは代わりの削除によって元の遺伝子に代りに戻ることができます実験します。
「ノックアウトのアプローチを使用してそこに両方の実験に有害な効果のようではないので遺伝子が両方ともゲノムから消費されることを推論できます。
「実際は代わりとなるパスが同じ製品へあるので、遺伝子のどちらかの除去によって他を存続のために必要にさせます; 各遺伝子の削除はゲノムのそれ以上の減少のための利用可能空間を減らします。
」最小のゲノムへのこれらの代わりとなるパスを含んでほとんど倍増しますサイズを」。
研究者は E.coli から展開させた 2 匹の細菌を使用して細菌のゲノムの内容を予測する方法を開発しました。
彼らが必要な基本的な食糧に対してホストに必要な分子を提供する共生関係の Buchnera および Wigglesworthia の生きている中の昆虫。
E.coli からの展開以来、 Buchnera および Wigglesworthia のゲノムは存続のために他では必要とする遺伝子のいくつかを失いました。
細菌の現在の生態学の計算機モデルおよび知識を使用して研究者は遺伝子の損失のこのプロセスを模倣できました。
彼らは正確に彼らのゲノムの非明らかな機能のいくつかを含む 2 匹の細菌の遺伝子の内容の約 80%、予測しました。
「病気のための原因であることどころか、昆虫はこれらの細菌が必要な栄養素をそれらに供給することを必要とします」教授を言いました Hurst。
「これらの比較的居心地のよい条件、 Buchnera および Wigglesworthia で他では存続させる必要がある基本的な分子のいくつかを作り出す必要がある遺伝子のいくつかを失いました。
「有機体の生態学に基づいてゲノムの内容を予測有用有機体の改革の異なった段階で遺伝子の内容を予測するのに私達が可能性としてはそれを使用できるのでですできることは。
実験室の漸進的な改革によって最小のゲノムを組み立てる 「これは理解するのをどのようにについての展開した助け、また experimentalists によって」。試みを知らせるべきですか私達が異なった有機体のゲノムが長い一定期間に詳細を
また同じような方法が望ましい新陳代謝の特性を持つ細菌の青写真を構築するのに例えばどの遺伝子が効率的に細目の不用な化学薬品を消化する細菌の必要性か識別使用されるかもしれません。
研究はハンガリーの科学研究の資金、 EMBO、人間フロンティア科学プログラム、 DFG および人間工学および生物科学の研究委員会によってサポートされました。
「最小の新陳代謝ネットワークの改革のチャンスそして必要は」 2006 年 3 月 30 日に実際のところ出版されます。
http://www.bath.ac.uk