Самым простым бактериям нужно почти дважды так много генов выдержать чем научные работники сперва, котор верят, согласно новому исследованию опубликованному в Природе (30-ое марта 2006).
Бактерии некоторые из самых простых форм жизни и изучали научными работниками пробуя определить самое малое собрание генов - или минимальный геном - который необходим на поддерживая жизнь.
Традиционно научные работники делали это путем извлекать, или ` стучая вне', серия индивидуальных генов от бактериального генома для того чтобы увидеть какое влияние это имеет на своей способности выдержать.
Они могут после этого infer которые гены необходимы к организму, и чточто нет, разработать которые необходимы для минимального генома.
Однако эт постучайте вне подходом неправильно извлекает много из генов которые необходимы к выживанию бактерий, согласно исследователям от Гейдельберга (Германии), Манчестера (ВЕЛИКОБРИТАНИИ), Будапешт (Венгрии) и Ванны (ВЕЛИКОБРИТАНИИ).
Исследователя сделали это открытие после начинать новый подход к моделированию генома которое, котор дали историю и знание организма постепеновскую своей окружающей окружающей среды, позволяет им предсказать которо гены геном бактерии должны содержать.
«Предыдущие попытки разработать минимальный геном полагались на удалять индивидуальные гены для того чтобы infer которые гены необходимы на поддерживая жизнь,» сказали Профессору Laurence Hurst от Отдела Биологии и Биохимии на Университете Ванны.
«Эт постучайте вне несоосностями подхода факт что альтернативные генетические трассы, или тропа, к продукции такого же клетчатого продукта.
«Когда вы стучаете вне одним геном, геном может компенсировать путем использование альтернативного гена.
«Но когда вы повторяете стук вне экспериментирует путем удалять алтернативу, геном может revert к первоначально гену вместо.
«Используя подход к нокдауна вы смогли infer что оба гена затрачиваемые от генома потому что кажется, что будет никакое deleterious влияние в обоих экспериментах.
«В действительности, потому что альтернативные тропа к такому же продукту, путем извлекать тот из генов вы делаете другое необходимым для выживания; каждое пропускание гена уменьшает доступный космос для более дальнеишего уменьшения генома.
» Включая эти альтернативные тропа в минимальный геном почти удваивает свой размер.»
Исследователя начинали путь предсказывать бактериальное содержание генома используя 2 бактерии которая эволюционировали от E.coli.
Насекомые в реальном маштабе времени Buchnera и Wigglesworthia внутренние в симбиозном отношении где они обеспечивают необходимые молекулы для их хозяина взамен необходимую основную еду.
С эволюционировать от E.coli, геномы Buchnera и Wigglesworthia теряли некоторые из генов которые им в противном случае было бы нужно для выживания.
Используя моделирование компьютера и знание присутствующей экологичности дня бактерий исследователя могли моделировать этот процесс потери гена.