細菌是某些生活的簡單形式和由設法的科學家學習了識別基因的最小的收藏 - 或是需要的在維護的壽命的最小的染色體 -。
傳統上科學家通過去除執行成交此或者的 `』,從一條細菌染色體的一系列的各自的基因發現什麼作用這有在其能力生存。
他們可以然後推斷為最小的染色體是需要的哪些基因對這個有機體是重要的,并且哪些不是,解決。
然而此请成交途徑錯誤地去除對細菌生存是重要的,根據從海得爾堡的許多基因 (德國),曼徹斯特 (英國),布達佩斯 (匈牙利) 和巴恩 (英國) 的研究員。
研究員在開發一個新的途徑以後做此發現對給出其周圍的環境有機體的演變歷史記錄和知識,給他們預測的染色體塑造哪基因細菌的染色體應該包含。
「早先嘗試制定出最小的染色體依靠刪除各自的基因為了推斷哪些基因對維護的壽命是重要的」,在巴恩大學說洛朗斯 Hurst 教授從生物系的和生化。
「此请擊倒途徑錯過這個情況有替代基因途徑,或者路,對同一個蜂窩電話產品的生產。
「當您擊倒一個基因時,通過使用一個替代基因,這條染色體可能補償。
「但是,當您重複這個成交時通過刪除替代試驗,這條染色體可能恢復到原始基因。
「使用擊倒途徑您可能推斷兩個基因從這條染色體是可犧牲的,因為那裡看來是在兩個實驗的沒有有害作用。
「實際上,因為有替代路對同一個產品,通過去除基因之一您使其他重要對生存; 每個基因刪除減少這條染色體的進一步減少的可用空間。
」包括這些替代路到最小的染色體裡幾乎加倍其範圍」。
研究員開發了預測細菌染色體目錄方式使用從 E.coli 演變的二細菌。
在他們為他們的主機提供重要分子以換取重要基本的食物的一個共生關係的 Buchnera 和 Wigglesworthia 活裡面昆蟲。
從演變從 E.coli, Buchnera 和 Wigglesworthia 染色體丟失他們為生存將否則需要的某些基因。
使用細菌的現在生態計算機模型和知識研究員能塑造基因損失的此進程。
他們準確地預測大約 80% 的二細菌的基因目錄,包括某些他們的染色體非明顯的功能。
「遠離是疾病的一個原因,昆蟲需要這些細菌把重要營養素供給他們」, Hurst 教授說。
「在這些相對地舒適情況、 Buchnera 和 Wigglesworthia 丟失他們將否則需要生產某些基本的分子他們需要生存的某些基因。
因為我們可能可能地使用它預測基因目錄在有機體的演變的不同的階段, 「能預測在有機體的生態基礎上的染色體的目錄是有用的。
「這在實驗室裡將幫助我們瞭解更多關於不同的有機體染色體如何演變在長的時期,并且應該也通知嘗試由 experimentalists 修建最小的染色體由逐漸演變」。
相似的方法也許也用於編譯細菌的圖紙與期望新陳代謝的屬性的,例如識別哪些基因會細菌需要高效地消化特定廢化學製品。
匈牙利科學研究資金、 EMBO、人力邊境科學程序、 DFG 和生物工藝學和生物科學研究會議支持這個研究。
『機會和必要性在最小的新陳代謝的網絡的演變』將被發布本質上在 2006年 3月 30日。
http://www.bath.ac.uk