Eine bahnbrechende statistische Technik, die an der Harvard-Schule des Öffentlichen Gesundheitswesens (HSPH) entwickelt wird hat geholfen, eine geläufige Genvariante zu kennzeichnen, die mit einer erhöhten Gefahr für Korpulenz verbunden ist.
Das Finden, das in vier anderen Proben von Kindern und von Erwachsenen des Europäischen und Afrikanischen Geschlechtes wiederholt worden ist, liefert eine ungewöhnlich starke Vereinigung zwischen einer Genvariante und einer komplexen Krankheit auf dem Gebiet des Vereinigungsabbildens.
Die Studie bezog ein internationales Team mit ein, das von den Forschern an der Boston-HochschulMedizinischen Fakultät (BUSM) geführt wurde gemeinsam mit Forschern an HSPH, das Krankenhaus der Kinder Boston, Nationales Forschungszentrum GSF, Technische Universität München, Universität Ludwigs Maximilians, Channing-Labor, Universität von Duisburg-Essen, Loyola-HochschulGesundheitszentrum und von SeraCare Life Sciences Inc.
Die Wissenschaftler kennzeichneten die Variante, indem sie 86.604 einzelne Nukleotidpolymorphien (SNPs) oder die DNA-Sequenz-prüften, Varianten, auf eine Vereinigung zum Body-Maß-Index (BMI), ein stellvertretendes Maß für Korpulenz. Das SNPs kam von den Blutproben von den Teilnehmern an die Framingham-Inner-Studie (FHS). BMI-Maße wurden von FHS-Forschern unter einem Vertrag vom Nationalen Herz-Lungen-- und Blut-Institut erfasst, das durch Boston-Universität verabreicht wurde.
Forscher an der BUSM-Genetik-und -Genomics-Abteilung, geführt vom führenden Autor und Assistenzprofessor Alan Herbert und älterer Autor und Abteilungs-Stuhl Michael Christman, genotyped die Proben und kennzeichneten genetische Varianten innerhalb sie für Vergleich. Das umfangreiche Genotyping wurde durch die Technologie des DNA-Chips 100K aktiviert, die durch Affymetrix, eine Firma entwickelt wurde, die in Santa Clara, Calif angesiedelt wurde. Datenverwaltung und Analyse wurden durch TEA erfolgt. Normanne Gerry und Marc Lenburg an BUSM- und HSPH-Forschungsstipendiaten Matthew McQueen.
Das Kennzeichen des SNP wurde durch eine neue statistische Technik ermöglicht, die von HSPH-Assistenzprofessor Christoph Lange entwickelt wurde, der ein älterer Autor auf dem Wissenschaftspapier, gemeinsam mit Professor-und Mitverfasser Nan-Gutsherrn ist, und von Kristel Van Steen, ehemaliger promovierter wissenschaftlicher Mitarbeiter.
Die Technik wendet eine bedeutende statistische Schwierigkeit ab, die das mehrfache Vergleichsproblem genannt wird, das verbittert wird, wenn man enorme Dateien knirscht. Je mehr SNPs in einer Studie, desto mehr Wahrscheinlichkeit von falsch-positiven Signalen, die erhöhte Gefahr, dass irgendein SNPs nicht geprüft werden -- selbst wenn sie möglicherweise lebensfähige Kandidaten sind.
Gewöhnlich würde eine Studie einen zweistufigen Prozess 1) der Anfangsprüfung von allem SNPs für Vereinigungen zu den spezifischen Merkmalen, wie Body-Maß-Index verlangen, und 2), nur die viel versprechendste Datei SNPs sofort prüfend.
Die HSPH-Berechnungsmethode handhabt das mehrfache Vergleichsproblem mit gerade einer Datei, indem sie den Umfang schätzt, dem Genetik Schwankungen eines spezifischen Merkmals erklären kann, und dann den viel versprechendsten Kandidaten SNPs für diesen genetischen Effekt kennzeichnet. Zu mehr Information über die Technik, sehen Sie http://www.hsph.harvard.edu/press/releases/press06052005.html.
Im Wissenschaftspapier wurde die HSPH-Methode angewendet, um ein SNP genau zu kennzeichnen, das von den zehn von den geprüften Tausenden auftauchte. Sie liegt nahe dem Gen INSIG2 (Insulin-verursachengen). Die Variante war in zehn Prozent der Bevölkerungen anwesend, die zwei Exemplaren studiert wurden und benötigt waren, um aktiv zu sein.
Wichtig arbeiteten die Wissenschaftler dann mit anderen Institutionen zusammen und wiederholten die Vereinigung zwischen dem SNP und dem Adipositasrisiko in vier anderen Bevölkerungen. Die Bevölkerungen umfaßten Familien und unverbundene Personen des unterschiedlichen Alters und des Unterschieds von ethnischen Hintergründen: