Una tecnica statistica aprente la strada sviluppata al Banco di Harvard della Salute pubblica (HSPH) ha contribuito ad identificare una variazione comune del gene connessa con un rischio aumentato per l'obesità.
L'individuazione, che è stata ripiegata in altri quattro campioni dei bambini e degli adulti dell'ascendenza Europea ed Africana, fornisce un'associazione insolitamente forte fra una variante del gene e una malattia complessa nel campo di mappatura di associazione.
Lo studio ha fatto partecipare un gruppo internazionale piombo dai ricercatori alla Scuola di Medicina di Boston University (BUSM) in collaborazione con i ricercatori a HSPH, l'Ospedale Pediatrico Boston, il Centro di Ricerca Nazionale di GSF, l'Università Tecnica Monaco Di Baviera, l'Università di Ludwig Maximilians, il Laboratorio di Channing, Università di Duisburg-Essen, Loyola University Medical Center e SeraCare Life Sciences Inc.
Gli scienziati hanno identificato la variante verificando le 86.604 singole variazioni di polimorfismi (SNPs) del nucleotide, o di sequenza del DNA, ad associazione all'indice di massa corporea (BMI), una misura sostitutiva per l'obesità. Lo SNPs è venuto dai campioni di sangue dai partecipanti allo Studio del Cuore di Framingham (FHS). Le misure di BMI sono state riunite dai ricercatori di FHS nel quadro di un contratto dall'Istituto Nazionale di Sangue e Cuore-polmoni amministrato dalla Boston University.
I Ricercatori al Dipartimento della Genetica e di Genomica di BUSM, piombo dall'autore principale e Assistente Universitario Alan Herbert ed autore e Presidenza di Dipartimento senior Michael Christman, genotyped i campioni, identificanti le variazioni genetiche loro per il confronto. Genotyping su grande scala è stato permesso a dalla tecnologia sviluppata da Affymetrix, una società di microarray del DNA 100K basata a Gestione di dati di Santa Clara, California e l'analisi è stata fatta da DRS. Normanno Gerry e Marc Lenburg al ricercatore Matthew McQueen di HSPH e di BUSM.
L'identificazione dello SNP è stata permessa da una nuova tecnica statistica sviluppata dall'Assistente Universitario Christoph Lange di HSPH, che è un autore senior sul documento di Scienza, in collaborazione con il Professor ed il co-author Nan Laird e da Kristel Van Steen, ex collega postdottorale.
La tecnica evita una difficoltà statistica più grave chiamata il problema multiplo di confronto, che è esacerbato quando sgranocchia gli insiemi di dati enormi. Più lo SNPs in uno studio, più probabilità dei segnali erroneamente positivi, il rischio aumentato che un certo SNPs non è provato -- anche se possono essere candidati possibili.
Tipicamente, uno studio richiederebbe un trattamento in due tappe 1) della prova iniziale di tutto lo SNPs per le associazioni ai tratti specifici, quale l'indice di massa corporea e 2) provando soltanto lo SNPs di promessa in un secondo insieme di dati.
Il metodo di analisi di HSPH tratta il problema multiplo di confronto con appena un insieme di dati stimando le dimensioni a cui la genetica può spiegare le variazioni in un tratto specifico e poi identificando il candidato di promessa SNPs per quell'effetto genetico. Per ulteriori informazioni sulla tecnica, vedi http://www.hsph.harvard.edu/press/releases/press06052005.html.
Nel documento di Scienza, il metodo di HSPH si è applicato per identificare esattamente uno SNP che è emerso dai decine di migliaia provati. Si trova vicino INSIG2 al gene (insulina-indurre-gene). La variante era presente in dieci per cento delle popolazioni studiate e richieste due copie per essere attiva.
D'importanza, gli scienziati poi hanno collaborato con altre istituzioni ed hanno ripiegato l'associazione fra lo SNP ed il rischio dell'obesità in altre quattro popolazioni. Le popolazioni hanno compreso sia le famiglie che gli argomenti senza correlazione di età differenti e delle origini etniche varianti: