公衆衛生 (HSPH) のハーバード学校で開発される開拓の統計的な技術は肥満のための高められた危険と関連付けられる共通の遺伝子の変化の識別を助けました。
子供とヨーロッパおよびアフリカの家系の大人の 4 つの他のサンプルで複製された見つけることは連合のマップのフィールドの遺伝子の等価異形暗号と複雑な病気間の珍しく強い連合を提供します。
調査は HSPH で研究者、小児病院ボストン導かれたの国際的なチームを GSF の各国用の研究所、技術的な大学ミュンヘンのルートビッヒ Maximilians 大学、 Channing の実験室、デュースブルクエッセン、 Loyola University Medical Center の大学と共同して (BUSM) ボストン大学の医科大学院で研究者によって、 SeraCare Life Sciences Inc. 含み。
科学者は連合のために 86,604 の単一のヌクレオチドの多形、または (SNPs)体格指数に DNA シーケンス変化を、テストすることによって等価異形暗号を、 (BMI)肥満のための代用の測定識別しました。 SNPs は Framingham の中心の調査の関係者からの血液サンプルから来ました (FHS)。 BMI の測定はボストン大学によって管理された各国用の心肺および血の協会からの契約の下の FHS の調査官によって集められました。
主執筆者および助教授がアランハーバートおよび年長の著者および部門椅子ミハエル Christman 導いた BUSM の遺伝学およびゲノミクス部の研究者は比較のためのそれらの内の遺伝の変化を識別するサンプルを genotyped。 大規模な genotyping は Affymetrix によって、サンタクララ開発された、 100K DNA のマイクロアレイの技術カリフォルニアので基づいて会社によってデータ管理可能になり、分析は Drs によって行われました。 BUSM および HSPH ののノルマン人ジェリーおよび Marc Lenburg 研究員 Matthew McQueen。
SNP の識別は教授および共著者のナンの地主と共同して科学のペーパーの年長の著者、である、および Kristel ヴァンスティーン、前の博士研究員が可能にされました HSPH の助教授クリストフ Lange 開発した新しく統計的な技術によって。
技術は悪化させる多重比較問題と呼出される主要で統計的な難しさを避けます巨大なデータセットを砕くとき。 SNPs がテストされないことより多くの調査、偽肯定的なシグナルのより多くの可能性、高められた危険の SNPs -- それらが実行可能な候補者であるかもしれないのに。
通常、調査は特定の特性に 1) 連合のためのすべての SNPs の最初のテストのツーステッププロセスを、体格指数のような、 2) 要求し第 2 データセットの最も有望な SNPs だけテストします。
HSPH の解析法は遺伝学が推定し特定の特性の変化を説明できるその遺伝の効果のための最も有望な候補者 SNPs を扱います範囲を識別することによってちょうど 1 つのデータセットとの多重比較問題を。 技術のより多くの情報のために、 http://www.hsph.harvard.edu/press/releases/press06052005.html を見て下さい。
科学のペーパーではテストされた数万から現れた 1 SNP を丁度識別するために、 HSPH 方法は適用されました。 それは INSIG2 遺伝子の近くにあります (インシュリン誘導遺伝子)。 等価異形暗号は 2 枚のコピーアクティブであるために調査され、必要な人口の 10% にありました。
重要なのは、科学者は他の施設とそして協力し、 4 人の他の人口の SNP と肥満の危険間の連合を複製しました。 人口は異なった年齢と民族的背景の変化の系列そして非関連の主題を両方含んでいました: