Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski

Общее изменение гена связало с увеличенным риском для тучности

Published on April 18, 2006 at 2:25 AM · No Comments

Pioneering статистически метод начатый на Школе Гарварда Общественных Здравоохранений (HSPH) помог определить общее изменение гена связанное с увеличенным риском для тучности.

Находить, который было скопирован в 4 других образцах детей и взрослых Европейской и Африканской родословной, обеспечивает необычно сильную ассоциацию между вариантом гена и сложным заболеванием в поле отображать ассоциации.

Изучение включило международную команду водить исследователями на Медицинском Факультете Университета Бостона (BUSM) в сотрудничестве с исследователями на HSPH, Больницей Детей Бостоном, Исследовательскийа Центр GSF Национальный, Технический Университет Мюнхен, Университет Ludwig Maximilians, Лаборатория Channing, Университет Дуйсбург-Эссена, Loyola Медицинский Университет Центр, и SeraCare Науки о Жизни Inc.

Научные работники определили вариант путем испытывать 86.604 одиночных изменения полиморфизмов (SNPs) нуклеотида, или последовательности ДНА, для ассоциации к индексу массы тела (BMI), суррогатное измерение для тучности. SNPs пришло от проб крови от участников в Изучении Сердца Framingham (FHS). Измерения BMI были собраны исследователями FHS под подрядом от Национальных Легкего Сердца и Института Крови управленных Университетом Бостона.

Исследователя на Отделе Генетики и Геномики BUSM, водить ведущим автор и Ассистентом Профессора Аланом Хербертом и старшими автором и Стулом Отдела Майкл Christman, genotyped образцы, определяя генетические изменения в пределах их для сравнения. Широкомасштабный genotyping было позволен технологией начатой Affymetrix, компанией microarray ДНА 100K основанной в Управление данными Santa Clara, CALIF. и анализ был сделан Drs. Норман Gerry и Марк Lenburg на научном сотруднике Matthew McQueen BUSM и HSPH.

Идентификация SNP было делано возможным новым статистически методом начатым Ассистентом Профессора Christoph Lange HSPH, который старший автор на бумаге Науки, в сотрудничестве с Помещиком Nan Профессора и соавтора, и Kristel Van Steen, бывшим postdoctoral собратом.

Метод отвращает главному статистически вызванному затруднению множественной проблемой сравнения, которая обостряна хрустя огромные наборы данных. Больше SNPs в изучении, больше вероятия ложн-положительных сигналов, увеличенном риске что некоторое SNPs не испытано -- даже если они могут быть жизнеспособными выбранными.

Типично, изучение потребовало бы процессу 2-шага 1) начального испытания всего SNPs для ассоциаций к специфическим чертам, как индекс массы тела, и 2) испытывающ только самое перспективнейшее SNPs в втором наборе данных.

Метод анализа HSPH регулирует множественную проблему сравнения с как раз одним набором данных путем оценивать размер к которому генетика может объяснить изменения в специфической черте, и после этого определять самый перспективнейший выбранный SNPs для того генетического действия. Для больше информации на методе, см. http://www.hsph.harvard.edu/press/releases/press06052005.html.

В бумаге Науки, метод HSPH был прикладной для того чтобы определить точно одно SNP которое вытекло от 10 испытанных тысяч. Он лежит около гена INSIG2 (инсулин-наводить-Джин). Вариант присутствовал в 10 процентах необходим населенностей изученных и 2 экземплярам для того чтобы быть активен.

Важно, научные работники после этого сотрудничали с другими заведениями и скопировали ассоциацию между SNP и риском тучности в 4 других населенностях. Населенности включили и семейства и non-родственные вопросы различных времен и меняя этнических происхождений: