Ved å identifisere nye gener kritisk til kreft progresjon, biologer ved US Department of Energy i Argonne National Laboratory har utvidet antallet narkotikarelaterte mål forskere har tilgjengelig for undersøkelse for å finne måter å stoppe svulster i deres spor.
Rapporten er publisert i Cancer Research .
Studien fokuserer på capillary formasjonen, eller angiogenese, en prosess vist seg å være avgjørende for tumorprogresjon som svulster tiltrekke capillaries å gi oksygen avgjørende for vekst og ofte bruker de samme fartøyene til å sende ut metastatisk celler. Ved nullstilling inn på disse kapillær-forming proteiner, kan stoffet forskerne kunne behandle en svulst ved direkte å kutte av sin blodtilførsel.
Drug forskere, bruk av verktøy tilgjengelig siden det menneskelige genom ble sekvensert, søke konkrete mål for å utvikle mer presise kreftlegemidler med færre bivirkninger. "Når du har en unik mål," forklarte biolog Diane Rodi, "du ikke har bivirkninger av medikamenter -. Fleste kreftlegemidler er anti-vekst medikamenter som dreper alt den voksende cellene i kroppen fleste kreft terapier er ikke svært spesifikke og det er derfor de er så giftige. "
Den Argonne biologer identifisert 217 proteiner involvert bare i kapillært dannelsen - morphogenesis - ved å finne alle de genprodukter slått på under capillary dannelse og trekke ut de som er knyttet bare til vekst, eller spredning, i en roman prosess som kalles subtraktiv transcriptomics.
Argonne biologer vokste humane endoteliale celler - cellene som er involvert i blodet fartøy dannelse - på en svulstvev-etterligne plate. Som kapillærer vokste over en 8-timers periode, isolerte forskerne RNA prøver i intervaller - på 30 minutter, 1 time, 2 timer, 4 timer og 8 timer. For å finne ut hvilke gener som ikke bidrar spesielt til blod fartøy dannelse, var endotelceller dyrket på gelatin-belagt plast. RNA ble isolert på samme intervaller som på svulstvev-etterligne plate.
Hver RNA prøven ble testet ved hjelp av microarray analyse ved University of Chicago. Den microarrays holde 44 000 prøver av kjente RNA kodet av det menneskelige genom. En reaksjon avslører RNA som blir produsert på hvert trinn i den biologiske prosessen. RNA koder for proteiner.
"Vi ønsket å finne proteiner som bare gjøres når endotelceller gjør et kapillar, ikke når de bare vokser," Rodi sa. "Vi tok alle de genene som ble gjort på vev plate og trekkes ut de fra plastplate. Og vi var igjen med 217."
Forskerne søkte proteiner i kapillærene bruke kommersielt tilgjengelige antistoffer. Av de 16 morphogenesis-spesifikke proteiner testet, ble alle funnet i kapillærene etter at de var fullstendig dannet.