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對人力微生物的社區的基因的第一個分析

Published on June 7, 2006 at 5:34 AM · No Comments

研究員完成了對社區人力微生物,有許多人力疾病的臨床診斷和處理的廣遠的涵義的成就基因的第一個分析。

這個分析的結果,執行由 UB 微生物學家的小組史蒂文 R. Gill 帶領, Ph.D。,在日記帳科學出現。

鰓,開展這個研究,當在基因組研究 (TIGR) 時學院與從 TIGR 的同事,斯坦福大學華盛頓大學,分析了微生物脫氧核糖核酸在人力末端食道的作為 「社區這全部」 -- 下個邊境在基因研究領域叫 metagenomics。

「人類基因組是人力基因汞合金,并且我們的微生物 『自基因』」,鰓說。 「无需瞭解我們的人力和微生物染色體,得到我們的生物的一張完全照片之間的交往是不可能的。

人類基因組缺乏劃分食物我們吃到能源重要對生存的一些重要酵素,提示鰓注意的情形,當細菌可能完全很好生存,不用他們的人力主機時,人會注定,不用他們的細菌合作夥伴。

「工作的最終目標」,他說, 「是開發為臨床工作者的工具使用在對待疾病。 這種知識,我們可以使用生物標誌識別這個單個的細菌人口。 臨床工作者能然後調整細菌的人口很好做該人員。 這樣分析也將確定哪些細菌對哪些抗生素是有抵抗性,和请幫助確定適當的藥物管理。

將來,健康單個可能經過對他們的食道的一個 metagenomic 分析確定他們的免疫狀態,并且對某些疾病的感受性, Gill 說。

傑費 I. 哥頓, M.D.,研究的一個主要貢獻者從染色體科學中心在華盛頓大學,注意到,此食道 「microbiome」項目是開發的新的藥物一個重要起點 21 世紀醫學的。

「我們的微生物合作夥伴無疑地開發了能力綜合幫助建立和持續他們的與我們的互利關係的新穎的化合物」,說哥頓。

「勘察這些 『自然產品的』和分析他們運行的路應該提供新的答案到許多的功能我們的人力基因,定義的我們的健康,識別緊急或充分地明顯疾病的新的方式新的方式,加上新的處理方法」。

雖然科學家發布了對從其他環境的範例的 metagenomic 分析,包括土壤和馬尾藻類海草海運,這是對人力位於的有機體的分析的第一發行。 研究員選擇調查大腸 microbiome,因為糞便範例是容易地可訪問的,因為人力胃腸道是這個機體的最密集地被填寫的微生物社區,并且,因為這些微生物執行許多重要功能。

這個分析的範例從二個未認出的單個派生了。 研究員知道只一個是男性,并且一个女性; 一个是素食主義者,一不是。 兩個納稅人在去年未接受抗生素,確保他們的小腸植物群的人口是 「正常」和穩定。

對他們的潛在的二個微生物社區的 Metagenomic 分析能執行人力新陳代謝的必要的功能向顯示兩個有重要細菌的充足的濃度,但是比較二識別重大的區別。

一個主題 「被豐富了」 -- 對一個特定類別的更多細菌的主機比預計 -- 对發電和轉換、碳水化合物運輸和新陳代謝、氨基酸運輸和新陳代謝和幾個其他功能。

「此 metagenomics 分析開始定義食道 microbiome 的基因目錄和編碼功能屬性在健康人的」,指明的鰓。 「我們在將來希望估計年齡、飲食和疾病的作用例如 IBS、癌症和肥胖病在末端食道的微生物社區在居住用不同的環境的人」。

週期性抽樣食道 microbiome,以及那些其他站點,例如嘴和皮膚,可能允許科學家確定環境更改的作用對我們的 「微進化」,鰓說。

本文的另外的作者是羅伯特 T. DeBoy,克萊爾 M. Fraser-Liggett 和卡倫從 TIGR 的 E. 納爾遜; 從馬里蘭大學的 Mihai 流行音樂; 保羅 B. Eckburg 和大衛從斯坦福大學的 A. Relman; 并且彼得 Turnbaugh 和大型裝配架從華盛頓大學的 S. 塞繆爾。

http://www.buffalo.edu