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Bioinformatica usata per avanzare ricerca umana di malattia

Published on June 18, 2006 at 3:45 PM · No Comments

L'uso dei computer avanzare ricerca umana di malattia - conosciuta come bioinformatica -- ha ricevuto una spinta importante dai ricercatori all'Istituto di La Jolla per il vaccinia-virus dell'Immunologia & di Allergia (LIAI), che la ha usata per predire con successo la risposta immunitaria ad uno dei virus più complessi conosciuti per equipaggiare -, che è utilizzato nel vaccino della vaiolo.

Le risposte immunitarie, che sono essenzialmente come l'organismo combatte un agente malattia-causante, sono un elemento cruciale di sviluppo del vaccino.

“Siamo emozionanti perché questo ulteriore convalida il ruolo importante che la bioinformatica può svolgere nello sviluppo degli strumenti diagnostici ed infine dei vaccini,„ ha detto Alessandro Sette, Ph.D., un esperto vaccino internazionalmente conosciuto e testa della Malattia Infettiva di LIAI e del Centro Emergenti di Biodifesa. “Abbiamo indicato che può rivelare con successo - con molto un alto livello di accuratezza -- la vasta maggioranza degli epitopi (obiettivi) che avvierebbero un'efficace risposta immunitaria contro un agente patogeno complesso.„

La Bioinformatica tiene l'interesse significativo in comunità scientifica a causa del suo potenziale di muovere più rapidamente la ricerca scientifica di andata ed a meno spesa che la prova di laboratorio tradizionale.

I risultati sono stati pubblicati questa settimana in un documento, “Un approccio di previsione di epitopo di consenso identifica la larghezza delle risposte murine di TCD8+-cell al vaccinia-virus,„ nella versione online della Biotecnologia della Natura del giornale. Lo scienziato Magdalini Moutaftsi di LIAI era l'autore principale sul documento.

Mentre bioinformatica - che usa i database di computer, gli algoritmi e le tecniche statistiche per analizzare le informazioni biologiche -- è già in uso come preannunciatore della risposta immunitaria, i risultati del gruppo di ricerca di LIAI erano significativi perché hanno dimostrato estremamente un tasso alto di accuratezza di previsione (95 per cento) in un agente patogeno molto complesso - il vaccinia-virus. Il vaccinia-virus è un virus non pericoloso utilizzato nel vaccino della vaiolo perché è collegato con il virus del vaiolo, che è l'agente della vaiolo. Il gruppo scientifico poteva provare l'accuratezza dei loro risultati del computer con sperimentazione animale.

“Prima, abbiamo saputo che i metodi che di previsione stavamo usando stavano funzionando, ma questo studio prova che funzionano molto bene con un alto livello di accuratezza,„ Sette ha detto.

I ricercatori hanno messo a fuoco la loro prova sul Complesso Principale di Istocompatibilità (MHC), che lega a determinati epitopi ed è chiave ad avviare il sistema immunitario per attaccare una cella infettata da virus. Gli Epitopi sono pezzi di virus quel i fuochi del sistema immunitario dell'organismo su quando comincia una risposta immunitaria. Capendo quale epitopi legheranno alla molecola di MHC e causano un attacco immune, gli scienziati possono usare quegli epitopi per sviluppare un vaccino per evitare la malattia - in questo caso alla vaiolo.