O uso de computadores para avançar a pesquisa de doenças humanas - conhecido como bioinformática - recebeu um grande impulso a partir de pesquisadores do Instituto La Jolla para Alergia e Imunologia (LIAI) , que têm usado com sucesso prever a resposta imune a um dos mais complexos vírus conhecido pelo homem - o vírus vaccinia, que é usado na vacina contra a varíola.
Respostas imunes, que são essencialmente a forma como o corpo luta contra um agente causador de doença, são um elemento crucial do desenvolvimento de vacinas.
"Estamos muito animado porque isso confirma ainda mais o papel importante que a bioinformática pode desempenhar no desenvolvimento de ferramentas de diagnóstico e, finalmente, as vacinas", disse Alessandro Sette, Ph.D., especialista em vacinas internacionalmente conhecidas e chefe de Doenças Emergentes LIAI do Infecciosas e Centro de Biodefesa . "Nós mostramos que ele pode revelar com sucesso - com um grau muito elevado de precisão -. A grande maioria dos epitopos (metas) que iria desencadear uma resposta imune eficaz contra um patógeno complexo"
Bioinformática tem grande interesse na comunidade científica devido ao seu potencial para mover a pesquisa científica para a frente mais rapidamente e com menos despesa do que testes de laboratório tradicional.
Os resultados foram publicados esta semana em um artigo, "A abordagem de previsão de consenso epítopo identifica a amplitude da TCD8 + murino de células-respostas ao vírus vaccinia", na versão online da revista Nature Biotechnology. LIAI cientista Magdalini Moutaftsi foi o principal autor do papel.
Enquanto bioinformática - que utiliza bases de dados informáticas, algoritmos e técnicas estatísticas para análise de informações biológicas - já está em uso como preditor de resposta imune, as conclusões da equipe de pesquisa LIAI foram importantes porque demonstraram uma taxa extremamente alta de precisão da previsão (95 por cento) em um patógeno muito complexo - o vírus vaccinia. O vírus é um vírus vaccinia não perigosas utilizadas na vacina contra a varíola porque ela está relacionada com o vírus da varíola, que é o agente da varíola. A equipe científica foi capaz de provar a exatidão dos resultados do seu computador através de testes em animais.
"Antes, nós sabíamos que os métodos de previsão que estávamos usando estavam trabalhando, mas este estudo prova que eles funcionam muito bem com um alto grau de precisão", disse Sette.
Os pesquisadores se concentraram seus testes no Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC), que se liga a certos epitopos e é a chave para acionar o sistema imunológico para atacar uma célula infectada por vírus. Epitopos são peças de um vírus que o sistema imunológico do corpo se concentra em quando começa uma resposta imune. Por entender que epítopos ligará à molécula MHC e causar um ataque do sistema imunológico, os cientistas podem usar esses epítopos para desenvolver uma vacina para prevenir doenças - neste caso para a varíola.