用于的分析复杂生物资料的学科提前人力疾病研究

使用计算机提前叫作分析复杂生物资料的学科 - 的人力疾病研究 -- 从研究员得到了主要提高在过敏 & 免疫学 (LIAI) La Jolla 学院，使用它顺利地预测免疫反应到已知其中一最复杂的病毒 - 牛痘病毒，用于天花疫苗。

免疫反应，根本是这个身体如何与一疾病导致的作用者战斗，是疫苗研制的一个关键的要素。

“我们是兴奋的，因为此更加进一步验证分析复杂生物资料的学科在诊断工具和根本地疫苗的发展可能扮演的重要角色”，说亚历山德罗 Sette、 Ph.D。， LIAI 的涌现的传染病和 Biodefense 中心一个闻名世界的疫苗专家和主任。 “我们向显示它可能顺利地显示 - 与非常高准确度 -- 将触发一个有效免疫反应复杂病原生物的绝大多数的表位 (目标)”。

分析复杂生物资料的学科在科学界上比传统实验室试验暂挂重大的兴趣由于其潜在迅速移动转接的科学研究和以较少代价。

发现在文件本周被发布了， “共识表位预测途径识别鼠科 TCD8+ 细胞回应广度对牛痘病毒的”，在日记帐本质生物工艺学的在线版本。 LIAI 科学家 Magdalini Moutaftsi 是本文的主要作者。

当使用计算机数据库、算法和统计技术分析生物信息的分析复杂生物资料的学科时 - -- 已经是在使用中的作为免疫反应的预报因子， LIAI 研究小组的发现是重大的，因为他们展示了预测准确性 (95%) 的一种非常高速率在非常复杂病原生物 - 牛痘病毒。 牛痘病毒是用于天花疫苗的非危险病毒，因为它与天花病毒有关，是天花作用者。 科学小组能通过动物试验证明他们的计算机结果的准确性。

“前面，我们知道我们使用的预测方法运作，但是此研究证明，他们很好与高准确度一起使用”， Sette 说。

研究员集中他们的测试于专业组织相容性复杂 (MHC)，束缚对某些表位并且是关键的对触发免疫系统攻击一个病毒被传染的细胞。 当它开始一个免疫反应时，表位是部分该的病毒机体的免疫系统重点在。 通过了解哪些表位将束缚对 MHC 分子并且导致一次免疫攻击，科学家能使用那些表位开发疫苗挡住病症 - 在这种情况下到天花。

科学家能通过计算机塑造查找 95% 的 MHC 约束表位。 “这第一次是表位 MHC 捆绑的分析复杂生物资料的学科预测可能占是现有的在非常象牛痘的复杂病原生物的几乎所有 (被瞄准的) 表位”，说 LIAI 研究员 Magdalini Moutaftsi。 LIAI 科学家推理表位 MHC 捆绑的分析复杂生物资料的学科预测途径将是可适用的对其他病毒。

“用于此研究的病毒的秀丽是它是存在的其中一最复杂，最大的病毒”，说 Moutaftsi。 “如果我们可以预测几乎从这样大病毒的所有 (被瞄准的) 表位，然后我们应该能为较不象流行性感冒、疱疹甚至 HIV 的复杂病毒非常容易地执行那和最终适用此方法于更大的微生物例如结核病”。

使用分析复杂生物资料的学科的大好处预测免疫系统目标，解释的 Sette，是它在实验室里解决需要制造和测试很大数量的肽查找哪个将启动一个免疫反应。 肽是可以由免疫系统可能地认可的氨基酸部分。 “字面上有千位肽”，解释的 Sette。 “您也许必须创建，并且测试数百甚至千位他们查找正确部分”，他说。 “与分析复杂生物资料的学科，计算机执行在非常复杂数学算法基础上的这个审查。 并且它比执行测试可能执行它在较少时间和以较少代价在实验室里”。

LIAI 科学小组通过比较结果验证了他们的计算机发现的准确性肽和全部的感染病毒的实验室试验在鼠标。 “我们学习了总回应处理被传染的细胞”， Sette 说。 “我们与这种回应比较它对由计算机预测的 50 个表位。 我们高兴地发现我们的预测可能占 95% 总回应处理病毒”。

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