用於的分析複雜生物資料的學科提前人力疾病研究

使用計算機提前叫作分析複雜生物資料的學科 - 的人力疾病研究 -- 從研究員得到了主要提高在過敏 & 免疫學 (LIAI) La Jolla 學院，使用它順利地預測免疫反應到已知其中一最複雜的病毒 - 牛痘病毒，用於天花疫苗。

免疫反應，根本是這個身體如何與一疾病導致的作用者戰鬥，是疫苗研製的一個關鍵的要素。

「我們是興奮的，因為此更加進一步驗證分析複雜生物資料的學科在診斷工具和根本地疫苗的發展可能扮演的重要角色」，說亞歷山德羅 Sette、 Ph.D。， LIAI 的湧現的傳染病和 Biodefense 中心一個聞名世界的疫苗專家和主任。 「我們向顯示它可能順利地顯示 - 與非常高準確度 -- 將觸發一個有效免疫反應複雜病原生物的绝大多數的表位 (目標)」。

分析複雜生物資料的學科在科學界上比傳統實驗室試驗暫掛重大的興趣由於其潛在迅速移動轉接的科學研究和以較少代價。

發現在文件本週被發布了， 「共識表位預測途徑識別鼠科 TCD8+ 細胞回應廣度對牛痘病毒的」，在日記帳本質生物工藝學的在線版本。 LIAI 科學家 Magdalini Moutaftsi 是本文的主要作者。

當使用計算機數據庫、算法和統計技術分析生物信息的分析複雜生物資料的學科時 - -- 已經是在使用中的作為免疫反應的預報因子， LIAI 研究小組的發現是重大的，因為他們展示了預測準確性 (95%) 的一種非常高速率在非常複雜病原生物 - 牛痘病毒。 牛痘病毒是用於天花疫苗的非危險病毒，因為它與天花病毒有關，是天花作用者。 科學小組能通過動物試驗證明他們的計算機結果的準確性。

「前面，我們知道我們使用的預測方法運作，但是此研究證明，他們很好與高準確度一起使用」， Sette 說。

研究員集中他們的測試於專業組織相容性複雜 (MHC)，束縛對某些表位并且是關鍵的對觸發免疫系統攻擊一個病毒被傳染的細胞。 當它開始一個免疫反應時，表位是部分該的病毒機體的免疫系統重點在。 通過瞭解哪些表位將束縛對 MHC 分子并且導致一次免疫攻擊，科學家能使用那些表位開發疫苗擋住病症 - 在這種情況下到天花。

科學家能通過計算機塑造查找 95% 的 MHC 約束表位。 「這第一次是表位 MHC 捆綁的分析複雜生物資料的學科預測可能佔是現有的在非常像牛痘的複雜病原生物的幾乎所有 (被瞄準的) 表位」，說 LIAI 研究員 Magdalini Moutaftsi。 LIAI 科學家推理表位 MHC 捆綁的分析複雜生物資料的學科預測途徑將是可適用的對其他病毒。

「用於此研究的病毒的秀麗是它是存在的其中一最複雜，最大的病毒」，說 Moutaftsi。 「如果我們可以預測幾乎從這樣大病毒的所有 (被瞄準的) 表位，然後我們應該能為較不像流行性感冒、疱疹甚至 HIV 的複雜病毒非常容易地執行那和最終適用此方法於更大的微生物例如結核病」。

使用分析複雜生物資料的學科的大好處預測免疫系統目標，解釋的 Sette，是它在實驗室裡解決需要製造和測試很大數量的肽查找哪個將啟動一個免疫反應。 肽是可以由免疫系統可能地認可的氨基酸部分。 「字面上有千位肽」，解釋的 Sette。 「您也許必須創建，并且測試數百甚至千位他們查找正確部分」，他說。 「與分析複雜生物資料的學科，計算機執行在非常複雜數學算法基礎上的這個審查。 并且它比執行測試可能執行它在較少時間和以較少代價在實驗室裡」。

LIAI 科學小組通過比較結果驗證了他們的計算機發現的準確性肽和全部的感染病毒的實驗室試驗在鼠標。 「我們學習了總回應處理被傳染的細胞」， Sette 說。 「我們與這種回應比較它對由計算機預測的 50 個表位。 我們高興地發現我們的預測可能佔 95% 總回應處理病毒」。

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