Nowy program przy Krajowym instytutem alergia i zaraźliwe choroby celuje lepiej rozumieć powikłane biochemiczne sieci które regulują interakcje między komórkami lub one infekuje. (NIAID)
Program w system immunologii i zaraźliwej choroby wzorowaniu (PSIIM) zatrudnia potężnego nowego podejście dzwoniącego obliczeniowa system biologia rozwijać głębokiego zrozumienie jak, jak patogeny powodują chorobę i system odpornościowy odpowiada one.
"Rozumieć zniechęcającą złożoność biologiczni systemy jest wielkim wyzwaniem i przy nowatorskim nauka w xxi wiek," mówi NIH dyrektora Elias A. Zerhouni, M.D. "tworzenie ten program umacnia śródściennego program badań na NIH kampusie tutaj."
Bogactwo zebiorący o ludzkim genomu informacja w ostatnich latach utożsamiał dużo geny, proteiny i inne molekuły wymagający w różnorodnych biologicznych systemach. Ale zrozumienie rozumiejący no jest well. jak te kawałki pracują wpólnie produkować powikłanego fizjologicznego, patologicznego zachowanie i komórki i organizmy Cel PSIIM który jest składnikiem NIAID'S podział Śródścienny badanie pod dowództwem immunologa Ronald N. Germain, M.D., Ph.D., (DIR) jest tworzyć sposób pytać jak, kiedy cali systemy molekuły, komórki i tkanki, oddziałają wzajemnie podczas reakci odpornościowej lub stawać twarzą w twarz z zakaźnym agentem.
"pomysł PSIIM," mówi NIAID dyrektora Anthony S. Fauci, M.D., "jest używać system biologię pozwolić naukowów pytać bardzo dużych pytania no mogą być sprawnie w pełni adresować nawet few rok temu -: jak, jak, jak zakaźni organizmy najeżdżają ludzkie komórki tak jak toksyny one produkują przyczyny tkanki i komórki zniszczenie i te patogeny unikają reakcję odpornościową lub manipulują."
Jak tylko rozumiemy te interakcje," mówi DIR dyrektora Kathryn C. Zoon, Ph.D., dodaje że te nowi wgląd mogą słuzyć jako baza wypadowa dla projekta nowi leki lub rozwoju nowe szczepionki fund choroby. "możemy robić strategicznym decyzjom o dlaczego ingerować z zaraźliwej choroby patologią, dlaczego kierować reakcje odpornościowe polepszać walk infekcje lub,
Tworzyć modelów komputeru powikłane cząsteczkowe interakcj sieci, PSIIM oficery śledczy będą sprawnie symulować biologię komórki, tkanki i organizmy, ostatecznie. Program także używa najnowocześniejszych eksperymentalnych podejścia ustalać jak blisko przepowiadają istnego zachowanie te symulacje. Gdy modele ulepszają, naukowowie podczas gdy walczą zakaźnego agenta. jak, czy leki i inne interwencje wpływają organizmu lub komórkę muszą zyskiwać zdolność przepowiadać i taki traktowania tolerują gospodarzem Chociaż najwięcej studia prowadzą z mniej niebezpiecznymi patogenami, specjalni udostępnienia w i Wyłaniać się przy NIH zaraźliwe choroby nowym C.W. Wystawiający rachunek Potomstwo centrum dla Biodefense umożliwiają PSIIM naukowów egzamininować taki pytania z drobnoustrojami które powodują choroby tak jak wąglik, wirulentne formy grypa, tularemia i dżuma. Program zachęca współpracę między NIAID badaczami i innymi naukowami od NIH w wysiłkach lepiej rozumieć zarówno wewnątrz jak i nazewnątrz zaraźliwe choroby i system odpornościowego.
Kamień węgielny PSIIM badawczy projekt jest pakietem oprogramowania dzwoniącym Simmune który umożliwia biolożki modelować wiele typ biologiczni systemy., Tworzy NIAID naukowem Martin meier-Schellersheim, Ph.D i jego koledzy. oprogramowanie pozwoli naukowa lub zachowań komórki używać prostego graficznego interfejs łatwo definiować interakcje między indywidualnymi molekułami w wielkiej sieci w odpowiedzi na zewnętrznie sygnały. Once naukowów wkładów ilościowa informacja uzyskująca laboranckimi pomiarami, Simmune może wtedy symulować zachowanie całość sygnalizacyjnej sieci całkowita komórka lub. Oprogramowanie robi to automatycznie tworzyć matematycznie modela zwijania specjalnych równania i wtedy rozwiązywać te równania dla specyfika uwarunkowywać użytkownika wchodzić do w program.