אינטראקציות בין חלבונים וחומצות גרעין לשחק תפקיד קריטי בכמה תהליכים חיוניים ביותר של החיים ביוכימי, כולל התבטאות גנים ייצור חלבון, וכמה סוכנים נגד סרטן מבטיחות להשפעות שלהם על ידי התערבות האינטראקציות הללו.
כעת, חוקרים כלי חדש לחקר יחסי גומלין אלה - סרגל אופטי ננומטרי מאשר יכול לזהות שינויים קטנים בגודל של פיסת נתון של דנ"א. עבודה זו דיווחו בגיליון הבכורה של כתב העת Nature Nanotechnology.
Fanqing פרנק חן, דוקטור, על ברקלי המעבדה הלאומית לורנס, הוביל צוות של חוקרים כי פיתח השליט nanoplasmonic תוכנן כדי למדוד שינויים באורך DNA כמותית בזמן אמת. השליט משתמש חלקיקי זהב והוא מסתמך על העובדה כי חלקיקי זהב פולטים אור באורכי גל מוגדרים היטב של האור באופן מושפעת במידה רבה על ידי הסביבה הפיסיקליות והכימיות המדויק סביב החלקיקים.
אחת הדרכים להשפיע על סביבתו כי היא לצרף פעמיים תקועים מולקולות דנ"א אל פני השטח של זהב nanoparticle. שימוש plasmon משטח ספקטרוסקופיית תהודה, החוקרים הצליחו למדוד את השינויים הקלים המתרחשים פליטת האור כמו אורך של קטע מצורף של דנ"א שונה בתגובה אינטראקציות עם חלבונים, כולל אנזימים משפיל-DNA המכונה nucleases.
כדי להדגים את צדדיות של הסרגל הזה, החוקרים יצרו פיסת 54 זוגות בסיסים של DNA המכיל אתרים מחשוף לסדרת nucleases מופץ לאורך הדנ"א. על ידי מדידת השינוי פליטת plasmon האור מן חלקיקי זהב, החוקרים הצליחו למדוד את המהירות שבה nuclease אחד היה מסוגל לחתוך DNA באתר המחשוף שלה בפרט.