Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Norsk | Русский | Svenska | Polski

De Flexibele interface tussen ligase van DNA en een heterotrimeric glijdende klem steunt conformational omschakeling en efficiënte afbinding van DNA

Published on October 20, 2006 at 5:24 PM · No Comments

De Wetenschappers die belangrijk een DNA-Reparatie enzym onderzoeken hebben nu een beter beeld van de definitieve stappen van een proces dat de lijm samen, of, de einden van de bundels van DNA afbindt om de dubbele schroef te herstellen.

Het enzym, ligase van DNA, herstelt miljoenen onderbrekingen van DNA die tijdens de normale cursus van het leven van een cel worden geproduceerd, bijvoorbeeld, samen met elkaar verbindend de overvloedige fragmenten van DNA die tijdens replicatie van het genetische materiaal in het verdelen van cellen worden gevormd.

„Onze studie toont aan dat ligase van DNA van een open, uitgebreide vorm op een gesloten, cirkelvorm overschakelt aangezien het zich bij DNA samen vastloopt aansluit,“ zegt de hogere auteur Tom Ellenberger, D.V.M, Ph.D., Raymond H. Wittcoff Professor en hoofd van de studie van de Afdeling van Biochemie en Moleculaire Biofysica op de Universitaire School van Washington van Geneeskunde in St.Louis. „Ligase lijkt op een polshorloge dat rond de einden sluit van DNA die.“ worden aangesloten bij

DNA is verrassend reactief en onder ononderbroken aanval van milieutoxine en reactieve cellulaire metabolites. Een middel om de schade van DNA te herstellen is essentieel voor het handhaven van de integriteit van de genetische blauwdruk.

Wanneer deze reparatieprocessen scheef gaan, kunnen de cellen defect zijn, sterven of kanker worden, zodat zouden de onderzoekers willen weten hoe de „werktuigkundigen van DNA“ hun werk doen. Ligases van DNA zijn aantrekkelijke doelstellingen voor de chemotherapie van kanker en andere ziekten.

Ligase van DNA werkt in overleg met een andere ringvormige proteïne dat als een glijdende klem wordt bekend. De Glijdende klemmen, zoals de menselijke proteïne PCNA, zijn meesterregelgevers van de reparatie van DNA, die dokkende plaatsen verstrekken die reparatieenzymen aan de plaats van schade aanwerven.

„Wanneer ligase de stapels tegen PCNA en DNA omringt, denken wij deze interactie andere reparatieproteïnen van PCNA uitwerpt,“ zegt Ellenberger. „In deze rol, kan ligase als definitieve leidende figuur dienen die van de reparatie van DNA verklaren, dat DNA in oorspronkelijke voorwaarde en klaar voor de definitieve stap van het eind van DNA het toetreden.“ is

In deze studie van ligase van DNA, die in de 20 kwestie van Okt. van Moleculaire Cel wordt gepubliceerd, teamed het onderzoeksteam van Ellenberger met wetenschappers van The Scripps Research Institute (TSRI), de Universiteit van de School van Maryland van Geneeskunde en het Nationale Laboratorium van Lawrence Berkeley (LBNL).

Om de ingewikkelde en dynamische structuren van ligase van DNA en PCNA, zowel afzonderlijk als in complex te visualiseren, Ellenberger en zijn groep Gingen die nauw met wetenschappers LBNL wordt samengewerkt uit de intense Röntgenstralen en uit de geavanceerde technologieën van het synchotronbeamline van SIBILLES voordeel te halen bij het laboratorium van Berkeley Lichtbron vooruit.