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脱氧核糖核酸连接酶和 heterotrimeric 下滑的钳位之间的灵活的界面支持构象的切换和脱氧核糖核酸的高效的结扎术

Published on October 20, 2006 at 5:24 PM · No Comments

调查重要脱氧核糖核酸维修服务酵素的科学家现在有进程的最后步骤的更好的照片一起胶合,或者绑扎,脱氧核糖核酸子线的末端恢复双重螺旋。

在细胞的生活的正常路线期间,酵素,脱氧核糖核酸连接酶,百万脱氧核糖核酸中断生成的维修服务,例如,一起链接在基因的副本时被形成的丰富的脱氧核糖核酸片段在分开细胞的。

“我们的研究向显示脱氧核糖核酸连接酶从开放,延长的形状转换到闭合,环形轧材,当它一起连接脱氧核糖核酸子线”,在华盛顿大学医学院说研究的高级作者汤姆 Ellenberger、 D.V.M、 Ph.D。,生化和分子生物物理学的部门的 Raymond H. Wittcoff 教授和负责人在圣路易斯。 “连接酶类似于在脱氧核糖核酸末端附近锁上被连接的手表”。

脱氧核糖核酸是惊奇地易反应和在从环境毒素和易反应的蜂窝电话代谢产物的持续攻击下。 修理脱氧核糖核酸故障方法对维护这张基因图纸的完整性是重要的。

当这些维修服务进程失败时,细胞可能发生故障,中断或者变得癌,因此研究员希望知道 “脱氧核糖核酸机械工”如何做他们的工作。 脱氧核糖核酸连接酶是癌症和其他疾病化疗的有吸引力的目标。

脱氧核糖核酸连接酶运作协力是公认的下滑的钳位另一环形的蛋白质。 下滑钳位,例如人力 PCNA 蛋白质,是脱氧核糖核酸维修服务重要资料管理者,提供吸收维修服务酵素到故障站点的相接站点。

“当 PCNA 的连接酶栈和包围脱氧核糖核酸时,我们认为此交往从 PCNA 抛出其他维修服务蛋白质”,说 Ellenberger。 “在此角色,连接酶可以担当脱氧核糖核酸维修服务的最终裁决者,确认脱氧核糖核酸在原始情况并且为最后一步脱氧核糖核酸结尾连接准备”。

在脱氧核糖核酸连接酶的此研究中,发布在分子细胞的 10月 20日问题, Ellenberger 的研究小组合作与从 Scripps 研究所、 (TSRI)马里兰大学医学院和劳伦斯伯克利国家实验室的科学家 (LBNL)。

要分别地形象化脱氧核糖核酸连接酶和 PCNA 复杂和动态结构,和在复杂, Ellenberger 和他的组严密地运作与 LBNL 科学家利用强烈的 X-射线,并且女巫同步加速器 beamline 的先进技术在伯克利实验室的提前光源。

研究员使用了 X-射线结晶学和小角度 X-射线分散的组合 (SAXS)。 他们进行了他们的与称有许多 multicelled 有机体的同样生物化学的特性的 Sulfolobus solfataricus 的一个模型有机体的研究,包括人。

“我们预计脱氧核糖核酸连接酶将锁上关闭,当被限制对环形的 PCNA 蛋白质”,说 Ellenberger。 “然而, SAXS 实验明显地向显示连接酶在开放相应一致保持使其他维修服务蛋白质束缚 PCNA,直到脱氧核糖核酸从事和关闭的连接酶短冷期”。

共同执笔者 LBNL 和 TSRI 的约翰 Tainer、 Ph.D。,教授,说结果第一次显示这些蛋白质在副本和维修服务期间,如何可能动态地装配和更改他们的形状连接脱氧核糖核酸末端。

脱氧核糖核酸对脱氧核糖核酸的连接酶区域的闭合的相应一致是印象的在 Ellenberger 的组以前报告的一个单独研究中。 Ellenberger 说挑战为将来是学习连接酶、 PCNA 和脱氧核糖核酸分子芭蕾舞蹈艺术在同一个实验,将要求分析 SAXS 数据新的方法。

“SAXS 方法提供形象化大蛋白质强大的手段,并且难或无法结晶的蛋白质复杂”, Ellenberger 说。 “复杂进程想象将要求对全部的动物解决生物组织的不同的级别从这个分子级别的各种各样的工具”。

对生物想象的研究是大学的 BioMed21 主动性的一个方面,要求转换基因结构知识成实际应用。

http://www.wustl.edu