Forskare som utforskar ett viktigt, DNA-reparerar enzymet har nu ett bättre att föreställa av finalen kliver av ett processaa, som limmar tillsammans, eller ligates, avslutar av DNA strandar till återställandet den dubbla spiralen.
Enzymet, DNA-ligase, reparerar miljoner av DNA-avbrott som frambrings under det normala, jagar av en cells liv, till exempel och att anknyta tillsammans de överflödande DNA-fragmenten som bildas under replication av det genetiska materiellt, i att dela celler.
”Visar Vår studie, att DNA-ligasen kopplar från ett öppet, fördjupat formar till ett stängt, formar cirkuläret, som det sammanfogar DNA strandar tillsammans,” något att säga studie höga författare Tom Ellenberger, D.V.M, Ph.D., Raymonden H. Wittcoff Professor, och huvudet av Avdelningen av Biochemistry och Molekylär Biophysics på den Washington Universitetar Skolar av Medicin i St Louis. ”Liknar ligasen ett armbandsur som låser runt om DNAEN avslutar, som sammanfogas.”,
DNA är förvånansvärt reactive och under fortlöpande anfall från miljö- toxins och reactive cell- metabolites. Är hjälpmedlet av att reparera DNA-skada livsviktigt till att underhålla fullständigheten av den genetiska ritningen.
När dessa reparerar, bearbetar går awry, celler kan krångla, dö eller bli den cancerous, så forskare skulle något liknande som vet hur ”DNA-mekaniker” gör deras jobb. DNA-ligases är attraktiva uppsätta som mål för kemoterapin av cancer och andra sjukdomar.
DNA-ligasen fungerar i konsert med ett annat bekant ringa-format protein, som en glidning klämmer fast. Glidning klämmer fast, liksom proteinet för människan PCNA, är ledar- regulatorer av DNA reparerar och att ge ansluta platser att rekryt reparerar enzym till platsen av skada.
”När ligasebuntar mot PCNA och omringar DNAEN, oss funderare som denna växelverkan skjuter ut annan reparerar proteiner från PCNA,” något att säga Ellenberger. ”I denna roll, ligase kan serven, som finalarbiteren av DNA reparerar som intygar att DNAEN är i pristine villkorar och ordnar till för finalen kliver av DNA avslutar att sammanfoga.”,
I denna studie av DNA-ligasen som publiceras i Oct.en 20, utfärda av den Molekylära Cellen, Ellenbergers forskninggruppen teamed med forskare från Det Scripps Forskningsinstitut (TSRI), Skolar Universitetar av Maryland av Medicin och Lawrence Berkeley MedborgareLaboratorium (LBNL).
Att visualisera det invecklat och dynamiskt strukturerar av DNA-ligase och PCNA, både separat, och i ett komplex, Röntgar Ellenberger och hans grupp som nära fungeras med LBNL-forskare för att ta fördel av det intensivt, och avancerade teknologier av SIBYLSsynchrotronbeamlinen på den Avancerade Ljusa Källan för det Berkeley labbet.
Forskarna använde en kombination av X-ray crystallography, och litet meta Röntgar spridningen (SAXS). De förade deras studier med en modelleraorganism som kallades den Sulfolobus solfataricusen, som har många av de samma biochemical kännetecknen av multicelled organismer, inklusive människor.