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脫氧核糖核酸連接酶和 heterotrimeric 下滑的鉗位之間的靈活的界面支持構像的切換和脫氧核糖核酸的高效的結紮術

Published on October 20, 2006 at 5:24 PM · No Comments

調查重要脫氧核糖核酸維修服務酵素的科學家現在有進程的最後步驟的更好的照片一起膠合,或者綁紮,脫氧核糖核酸子線的末端恢復雙重螺旋。

在細胞的生活的正常路線期間,酵素,脫氧核糖核酸連接酶,百萬脫氧核糖核酸中斷生成的維修服務,例如,一起鏈接在基因的副本時被形成的豐富的脫氧核糖核酸片段在分開細胞的。

「我們的研究向顯示脫氧核糖核酸連接酶從開放,延長的形狀轉換到閉合,環形軋材,當它一起連接脫氧核糖核酸子線」,在華盛頓大學醫學院說研究的高級作者湯姆 Ellenberger、 D.V.M、 Ph.D。,生化和分子生物物理學的部門的 Raymond H. Wittcoff 教授和負責人在聖路易斯。 「連接酶類似於在脫氧核糖核酸末端附近鎖上被連接的手錶」。

脫氧核糖核酸是驚奇地易反應和在從環境毒素和易反應的蜂窩電話代謝產物的持續攻擊下。 修理脫氧核糖核酸故障方法對維護這張基因圖紙的完整性是重要的。

當這些維修服務進程失敗時,細胞可能發生故障,中斷或者變得癌,因此研究員希望知道 「脫氧核糖核酸機械工」如何做他們的工作。 脫氧核糖核酸連接酶是癌症和其他疾病化療的有吸引力的目標。

脫氧核糖核酸連接酶運作協力是公認的下滑的鉗位另一環形的蛋白質。 下滑鉗位,例如人力 PCNA 蛋白質,是脫氧核糖核酸維修服務重要資料管理者,提供吸收維修服務酵素到故障站點的相接站點。

「當 PCNA 的連接酶棧和包圍脫氧核糖核酸時,我們認為此交往從 PCNA 拋出其他維修服務蛋白質」,說 Ellenberger。 「在此角色,連接酶可以擔當脫氧核糖核酸維修服務的最終裁決者,確認脫氧核糖核酸在原始情況并且為最後一步脫氧核糖核酸結尾連接準備」。

在脫氧核糖核酸連接酶的此研究中,發布在分子細胞的 10月 20日問題, Ellenberger 的研究小組合作與從 Scripps 研究所、 (TSRI)馬里蘭大學醫學院和勞倫斯伯克利國家實驗室的科學家 (LBNL)。

要分別地形象化脫氧核糖核酸連接酶和 PCNA 複雜和動態結構,和在複雜, Ellenberger 和他的組嚴密地運作與 LBNL 科學家利用強烈的 X-射線,并且女巫同步加速器 beamline 的先進技術在伯克利實驗室的提前光源。

研究員使用了 X-射線結晶學和小角度 X-射線分散的組合 (SAXS)。 他們進行了他們的與稱有許多 multicelled 有機體的同樣生物化學的特性的 Sulfolobus solfataricus 的一個模型有機體的研究,包括人。

「我們預計脫氧核糖核酸連接酶將鎖上關閉,當被限制對環形的 PCNA 蛋白質」,說 Ellenberger。 「然而, SAXS 實驗明顯地向顯示連接酶在開放相應一致保持使其他維修服務蛋白質束縛 PCNA,直到脫氧核糖核酸從事和關閉的連接酶短冷期」。

共同執筆者 LBNL 和 TSRI 的約翰 Tainer、 Ph.D。,教授,說結果第一次顯示這些蛋白質在副本和維修服務期間,如何可能動態地裝配和更改他們的形狀連接脫氧核糖核酸末端。

脫氧核糖核酸對脫氧核糖核酸的連接酶區域的閉合的相應一致是印象的在 Ellenberger 的組以前報告的一個單獨研究中。 Ellenberger 說挑戰為將來是學習連接酶、 PCNA 和脫氧核糖核酸分子芭蕾舞蹈藝術在同一個實驗,將要求分析 SAXS 數據新的方法。

「SAXS 方法提供形象化大蛋白質強大的手段,并且難或無法結晶的蛋白質複雜」, Ellenberger 說。 「複雜進程想像將要求對全部的動物解決生物組織的不同的級別從這個分子級別的各種各樣的工具」。

對生物想像的研究是大學的 BioMed21 主動性的一個方面,要求轉換基因結構知識成實際應用。

http://www.wustl.edu