Wetenschappers van de Universiteit van Colorado in Boulder en de Centers for Disease Control en Prevention (CDC) hebben een goedkope "gen-chip" test gebaseerd op een enkele influenzavirus gen waardoor wetenschappers snel te identificeren griepvirussen, waaronder aviaire influenza H5N1.
De onderzoekers gebruikten de MChip om H5N1 te detecteren in monsters verzameld over een periode van drie jaar van mensen en dieren in geografisch verspreide locaties. In tests op 24 H5N1 virale isolaten, de chip die volledige informatie over virus-type en subtype in 21 gevallen en gaf geen fout-positieve resultaten, het verslag van de wetenschappers. Ze zeggen dat de MChip kan een aanzienlijk voordeel ten opzichte beschikbare testen te bieden, omdat het gebaseerd is op een enkel gen segment dat muteert minder vaak dan de griep genen meestal gebruikt in diagnostische tests. Als gevolg hiervan kan de MChip niet te worden aangepast zo vaak bij te houden met de veranderende virus.
Het onderzoek werd geleid door de Universiteit van Colorado wetenschapper Kathy L. Rowlen, Ph.D., en gefinancierd door het Nationaal Instituut voor Allergie en Infectieziekten (NIAID) , onderdeel van de National Institutes of Health. Een papieren beschrijving van de werken, nu online beschikbaar, is gepland om te verschijnen in het december 15 Afgifte van de American Chemical Society's tijdschrift Analytical Chemistry.
"Zorgen over een mogelijke grieppandemie maken het noodzakelijk dat we doorgaan met betrouwbare en eenvoudig te gebruiken diagnostische tests voor H5N1 dat kan worden ingezet op het terrein met vermoedelijke uitbraak bedenken", zegt directeur Anthony NIAID S. Fauci, MD "The MChip ontwikkeld door Dr Rowlen en haar collega's presteerden uitstekend in de eerste tests en heeft het potentieel om een waardevol instrument in de wereldwijde influenza surveillance inspanningen. "
De MChip heeft een aantal voordelen ten opzichte van de FluChip, een griep diagnostisch eerder ontwikkeld door hetzelfde onderzoeksteam, zegt Dr Rowlen. Terwijl de FluChip is gebaseerd op drie influenza genen - hemagglutinine (HA), neuraminidase (NA) en matrix (M) - het MChip is gebaseerd op een gen segment. In tegenstelling tot de HA en NA, die voortdurend muteren en zijn dus technisch moeilijk te gebruiken om gen-chip diagnostische tests te ontwikkelen, het M-gen segment muteert veel minder snel, Dr Rowlen uit. "De M-gen segment is veel minder van een bewegend doel is dan de HA of NA gen. Wij zijn van mening dat een test op basis van dit relatief onveranderlijke gen segment zal worden robuuster, omdat het zal blijven nauwkeurige resultaten, zelfs als de HA en NA genen muteren in de tijd. Het werk samengevat in onze papieren er sterk op dat idee steunt, "zegt ze.
Een ander potentieel voordeel is dat de MChip zou voor de eerste keer, maak dan een manier om tegelijkertijd het scherm grote aantallen griep monsters naar het type en subtype van het virus aanwezig is te leren. Huidige real-time testen geven informatie over het type virus (type A of B) in een monster, maar aanvullend onderzoek moet worden uitgevoerd om het virus subtype te bepalen (bijvoorbeeld H5N1 subtype.)