Published on February 21, 2007 at 2:00 PM
2000多名人类和禽流感病毒来自世界各地的样本采取的整个基因蓝图已经完成,并在公共数据库的序列数据。
说:“这些信息将有助于科学家们理解流感病毒如何进化和传播,医学博士,美国国立卫生研究院院长Elias A.泽鲁尼”,它会在新的流感疫苗,治疗和诊断的发展援助。“
NIAID的导演安东尼福西博士说:“世界各地的科学家可以使用的序列数据来比较不同病毒株,确定的遗传因素,确定其毒性,并寻找新的治疗,疫苗和诊断指标,”
流感基因组测序项目,在2004年开始,一直进行NIAID资助的微生物测序中心由马里兰州罗克维尔的基因组研究研究所(TIGR)的管理。近日,不断增长的测序能力,使生产速度提高到每月200多个病毒的基因组。的微生物测序中心高一筹今天的2000基因组中的里程碑,将继续迅速序列更多的流感毒株和分离,将使所有的序列数据自由可用的科学界和公众通过GenBank中,一个维持基因序列的Internet访问数据库国家生物技术信息(NCBI)的中心,国立卫生研究院的医学国家图书馆,该项目的另一个主要贡献者。
季节性流感在美国是一个重大的的公共卫生问题,占约36,000人死亡,20万住院每年。在全球范围内,估计有25万死亡人数每年五十万的流感结果。季节性流感疫苗每年更新,流通中的最新株的目标。开发这种疫苗是具有挑战性的,但是,由于流感病毒的高突变率容易复制,而这些突变可以改变的病毒,足以对另一株,1株疫苗可能无法保护。
更令人关注的是出现一个新的高度致命病毒株,从人到人,很容易传染引起流感大流行的潜力。流感大流行发生在上个世纪的三次,其中最致命的是1918年的大流行,造成全球估计有40至50万例死亡。
“几年前,只限于对流感病毒的遗传信息,存在于公共领域,多序列数据是不完整的的,说:”玛丽亚Y.乔瓦尼,博士,谁负责NIAID的微生物测序分“RS。 ?流感基因组测序项目,填补这一差距大大提高流感序列数据量,并迅速提供给整个科学界。随后,出现了流感的基因组序列数据存入到全世界的科学家的数量明显增加公共领域,包括在圣裘德儿童研究医院的科学家和疾病控制和预防中心“。
随着NIAID的,TIGR和NCBI,该项目的其他合作者包括在纽约州奥尔巴尼的纽约州卫生署沃兹沃斯中心,在亚特兰大的疾病控制和预防中心在田纳西州孟菲斯圣犹大儿童研究医院;的动物健康/食品及农业组织,联合国(世界动物卫生组织/粮农组织)参考纽卡斯尔病和意大利帕多瓦禽流感实验室的世界组织,美国俄亥俄州立大学在哥伦布,俄亥俄州,波士顿儿童医院;贝勒医学院在休斯顿,并在新西兰基督城坎特伯雷卫生实验室。
有关流感基因组测序项目和流感病毒序列数据的访问的更多信息可在
为了帮助分析和解释项目所产生的序列数据的大量使用,NIAID的已资助的BioHealthBase生物信息资源中心,这是正在由在得克萨斯大学西南医学中心在达拉斯和诺斯罗普格鲁门公司的信息技术的生命科学开发的研究人员开发司在美国马里兰州罗克维尔。该中心提供了科学界与生物信息学和软件工具和强大的流感基因组及相关数据,在一个用户友好的的格式访问的入境。 BioHealthBase最近在洛斯阿拉莫斯国家实验室建立了合作与流感序列数据库,提供流感研究人员计算的数据管理和分析资源,以协助解释的遗传数据。的流感基因组测序项目的数据,以及所有其他公开可用的流感序列数据,是也可通过NCBI的流感病毒资源,包括一个分析工具的主机,如序列对齐和建设“树”显示进化关系,。
这些数据库和其他流感数据分析工具的更多信息可以访问BioHealthBase
http://www.niaid.nih.gov/
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