Eine internationale Gruppe Wissenschaftler hat eine bedeutende Reihenentwicklung einer Lingua Franca angekündigt, die verwendet wird, um die Aktivitäten von Genen in lebenden Organismen zu beschreiben.
Die Reihenentwicklung liefert Ausdrücke, die Wissenschaftler verwenden können, um die komplexen Ereignisse zu beschreiben, die auftreten, wenn eine pathogene oder nützliche Mikrobe seinen Hauptrechner antrifft. Diese Ereignisse Zu Verstehen ist für das Entwickeln von neuen Interventionen für das Verhindern von Infektion durch Krankheit-verursachende Mikroben beim Erhalt oder Anregung des Vorhandenseins der nützlichen Mikroben entscheidend. Die Einheitssprache in Entwicklung in dieser Bemühung wird die Gen-Ontologie genannt (GO). Die neuen Ausdrücke, die GO hinzugefügt werden, polstern beträchtlich, was bereits ein leistungsfähiges Hilfsmittel ist, damit Wissenschaftler die Funktionen von Genen und von Proteinen in einer großen Auswahl von Krankheit-bedingten Organismen vergleichen. Die laufende Initiative ist ein Teil des Pflanze-Verbundenen Mikroben-Gen-Ontologie (PAMGO)projektes, eine neu-festgelegte Interessengruppe des weltweiten Gen-Ontologie-Konsortiums.
Das GEHUNG Konsortium hat seit 2000 gearbeitet, um eine gemeinsame Sprache von Ausdrücken zu entwickeln, die verwendet werden können, um zu beschreiben, wie einzelne Gene in den verschiedenen Organismen arbeiten. Das PAMGO-Projekt wird durch die National Science Foundation und durch die Nationale Forschungs-Initiative der USDA-GenossenschaftsZustands-Forschung, der Ausbildung und der Ergänzungsdienstleistungen unterstützt.
Candace Collmer, Professor der Biologie an Wells-College und einer der Projektleiter auf dem Projekt erklärt: „Mikroben, die mit Pflanzen dazugehören, oder Tiere pathogen, neutral, oder nützlich sein können, aber alle teilen viele geläufigen Prozesse in ihren Interaktionen mit ihren Hauptrechnern. Zum Beispiel müssen alle zum Hauptrechner zuerst befestigen. Dementsprechend von Anfang an vom PAMGO-Projekt, stellten wir sorgfältig die neuen Ausdrücke her, damit sie würden sein nützlich für die Beschreibung von gutartigen sowie pathogenen Mikroben in den Pflanzen- oder Tierhauptrechnern.“
Brett Tyler, Professor am Virginia-Bioinformatik-Institut und am PAMGO-Projektleiter, erwähnte: „Ein geläufiges Set Ausdrücke Zu Haben zum von Genen von pathogenen und nützlichen Mikroben sowie von Organismen zu beschreiben, die sie in Kontakt mit kommen ist ein entscheidender Schritt in Verständnishauptrechner-mikrobeumgebung Interaktionen. Indem sie ein genaues Vokabular für die Funktionen dieser Gene zur Verfügung stellen, können Wissenschaftler unter Mikroben die vielen Prozesse vergleichen, die bilden die Wechselwirkung zwischen einer Mikrobe und seinem Hauptrechner.“
Dr. Tyler fügte hinzu: „PAMGO fing mit dem Ziel des Erstellens von Ausdrücken, um zu beschreiben an, wie Mikroben auf Pflanzen einwirken. Jedoch stellten wir schnell fest, dass fast alle Ausdrücke zu den Mikroben relevant waren, die auf Tiere und Menschen einwirken, und die Antwort von den Forschern, die studieren, menschlich und von den Tierkrankheiten ist gewesen sehr enthusiastisch.“
„Ein geläufiges Set Ausdrücke für den Nachrichtenaustausch über Mikrobehauptrechner Interaktionen hilft Forschern, Informationen zu kommunizieren und erweitert Konzepte von den Studien von Mikroben und ihre Hauptrechner,“ sagte Maryanna Henkart, Direktor der Abteilung der National Science Foundation der Molekularen und Zellulären Biowissenschaften.