微生物ホストの相互作用にかかわる遺伝子の製品を記述するための新しいターム

科学者の国際的なグループは生きている有機体で遺伝子の作業を記述するのに使用される混成語の主要な拡張を発表しました。

拡張は病原性のあるか有利な微生物がホストに出会うと発生する複雑なイベントを記述するのに科学者が使用できるタームを提供します。 これらのイベントを理解することは病気引き起す微生物によって伝染を防ぐための新しい介在を開発するために重大で有利な微生物の存在を維持しているか、または励まします。 この努力の開発の下の統一された言語は遺伝子の存在論と呼出されます (GO)。 GO に追加された新しいタームはかなり病気関連の有機体の広い範囲の遺伝子そして蛋白質の機能を比較する科学者のための強力なツールは既にであるものささえます。 進行中のイニシアチブはプラント準の微生物の遺伝子の存在論のプロジェクト、 (PAMGO)世界的な遺伝子の存在論の借款団の最近確立された利益団体の部分です。

行の借款団は 2000 年以来個々の遺伝子が多様な有機体でどのように作用するか記述するのに使用することができるタームのずっと共通言語を開発するために働いています。 PAMGO のプロジェクトは全米科学財団と米国農務省の協力的な州の研究、教育および拡張サービスの各国用の研究のイニシアチブによってサポートされます。

Candace Collmer、教授そして説明されるプロジェクトの主任調査官の Wells の大学の生物学の者: 「プラントと関連付けるかまたは動物が病原性のある、中立かまたは有利である場合もある微生物すべてはホストによって彼らの相互作用の多くの共通プロセスを共有しますが。 例えば、すべてはホストに最初に接続しなければなりません。 したがって、最初から PAMGO のプロジェクトの、私達は注意深くそれらがプラントまたは動物のホストで温和な、また病原性のある微生物を記述するために有用」。であるのは新しいタームを合わせたからです

、 Brett Tyler はヴァージニアの生物情報学の協会および PAMGO のプロジェクト・リーダーの教授気づきました: 「接触にとの入って来る有機体、また病原性のあり、有利な微生物の遺伝子を記述する共通の一組のタームをホスト微生物環境の相互作用の理解のクリティカルステップです持っていることは。 これらの遺伝子の機能に精密な用語を提供することによって、科学者は微生物間で微生物とホスト間の相互作用を」。構成する多くのプロセスを比較できます

Tyler 先生は付け加えました: 「PAMGO は微生物がプラントとどのように相互に作用しているか記述するためにタームの作成の目的から開始しました。 ただし、私達はすぐにほとんどすべてのタームが動物および人間と相互に作用している、調査する人間を研究者およびずっと動物の疾病からの応答は非常に熱狂的」。です微生物に関連していたことを認識し

「共通の一組の微生物ホストの相互作用についての情報交換のためのターム研究者が情報を伝えるのを助け微生物の調査からの概念を拡大し、彼らのホスト」、は Maryanna Henkart を全米科学財団の分子および細胞生物科学の部分のディレクター言いました。

PAMGO のプロジェクトが始まったときにプロジェクトの科学者のヴァージニアの生物情報学の協会の Joao セトゥバル、次長および者は見つけられた生物的機能およびプロセスを微生物で記述すること、非常に微生物が使用したホストとの連合で機能を記述するための少数のために、コメントしました 「、多数ターム行きます存在していました」。

Trudy Torto-Alalibo の PAMGO の事業の調整者は、気づきました: 「行の借款団はすべてのユーザーを実行中にタームの進行中の洗練に貢献する割り当てる方法でセットアップされました。 科学者が PAMGO に新しいタームを入れるとき総合に加わることを微生物がホストによってどのようにの関連付けるか全体のコミュニティが共通の理解の可能にします。 これはですホスト病原体関係の私達の理解を進める途方もないオープンソースリソースおよび強力な方法」。

ミシェール Gwinn-Giglio、 Genomic 研究 (TIGR) のための協会および気づかれる年長 PAMGO のメンバーのスタッフの科学者: 「PAMGO のそれはのための成長タームのプロセス中にすぐに明白ことホストを取扱う微生物の使用が実際にかなりユニバーサルのメカニズムでした。 同じタームは線虫のワームから細菌まで及ぶ種に使用することができます。 あることは適切なのこれらのタームが非常に高めますこの領域の研究を」。

現在のアップデートでは、ジェーン Lomax およびヨーロッパの生物情報学の協会の行の借款団の編集室のアメリアアイルランドと共同する PAMGO の借款団は、微生物ホストの相互作用にかかわる遺伝子の製品を記述するための 450 以上の新しいタームを解放しました。

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