Com os $8,5 milhões no apoio federal, os pesquisadores principais em três universidades, incluindo Johns Hopkins, estão criando uma rede digital ambiciosa que permita pesquisadores cardiovasculares no mundo inteiro facilmente aos dados e à experiência de troca em doenças coração-relacionadas.
O projecto, chamado a Grade Cardiovascular da Pesquisa, é esperado ser um benefício à grande comunidade dos pesquisadores do coração que usarão estas ferramentas digitais para encontrar maneiras novas de impedir, detectar e tratar doenças cardíacas risco de vida.
Para lançar este esforço, o Coração Nacional, o Pulmão e o Instituto do Sangue, parte dos Institutos de Saúde Nacionais, aprovaram uma concessão $8,5 milhões a ser atribuída durante um período de quatro anos que começasse o 1º de março. O projecto digital será baseado no Instituto para a Medicina Computacional em Johns Hopkins, em colaboração com o Departamento da Informática Biomedicável na Faculdade de Universidade Estadual do Ohio da Medicina e o Centro para a Pesquisa em Sistemas Biológicos no University Of California, San Diego.
As equipes de projecto desenvolverão as ferramentas de software abertas, grade-baseadas que permitirão outros grupos de investigação de se transformar “nós” na grade nova. Conectado Uma Vez à grade, os pesquisadores poderão alcançar e para compartilhar de ferramentas experimentais dos dados, de análise dos dados e de modelos computacionais em relação ao coração funcione em povos saudáveis e naqueles com doença cardíaca. Para proteger a privacidade, nenhuns dos dados do coração levarão a informação que identifica os pacientes de quem foi obtida.
“Tinha havido nunca um simples e maneira directa para que os pesquisadores cardiovasculares compartilhem, para analisar e modelar estes dados importantes,” disse Raimond Winslow, director do Instituto para a Medicina Computacional em Johns Hopkins e investigador principal no projecto. “Agora, haverá.”
Winslow, que igualmente é um professor no Departamento da Engenharia Biomedicável, adicionado, “Isto é o sentido em que a pesquisa biomedicável está dirigindo no século XXI. No passado, a pesquisa biomedicável foi feita principalmente em laboratórios individuais. A Grade Cardiovascular da Pesquisa permitir-nos-á de montar grandes, equipas de investigação geogràfica distribuídas e de reunir os peritos principais no mundo para centrar-se sobre um problema comum, apesar de seu lugar. Esta grade permitirá experimentalists de compartilhar de seus dados com os cientistas computacionais, que analisarão e modelarão os dados. Os cientistas computacionais compartilharão então de seus resultados com seus colegas experimentais, que a usam para refinar suas experiências. Deste modo, nós acreditamos que a criação da Grade Cardiovascular da Pesquisa acelerará a descoberta de aproximações novas para tratar a doença cardíaca.”
Em decidir financiar a grade nova, o Coração, o Pulmão e o Instituto Nacionais do Sangue reconheceram a contribuição importante que a bioinformática pode agora fazer em desenvolver uma compreensão mais profunda dos mecanismos da doença cardíaca e na revelação de aproximações terapêuticas novas.
Durante o primeiro ano de financiamento, os organizadores do plano novo da grade distribuirão a infra-estrutura e o software iniciais que permitirão pesquisadores de começar a compartilhar e analisar da informação. Para realizar este, Joel Saltz, cadeira do Departamento da Informática Biomedicável no Estado de Ohio, e na sua equipe desenvolverá a infra-estrutura do software que amarra junto recursos na grade. “A Grade Cardiovascular da Pesquisa permitirá que os peritos das disciplinas diferentes combinem suas introspecções e para coordenar seus esforços,” disse Saltz, que guardara a Cadeira Dotada Davis do Estado de Ohio do Cancro. “A capacidade para reunir muitos tipos de informação biomedicável terá um impacto tremendo no ritmo do progresso na pesquisa cardiovascular”
A equipe de Johns Hopkins centrar-se-á sobre a revelação de vocabulários estandardizados para descrever aplicações biomedicáveis da análise dos dados, dos modelos e de dados. Além do que Winslow, a equipe incluirá os membros da faculdade Michael I. Miller e Tilak Ratnanather do Departamento da Engenharia Biomedicável; e Donald Geman, Daniel Naiman e Laurent Younes, tudo do Departamento de Matemática Aplicada e de Estatísticas.
Marque Ellisman, director do Centro Nacional para a Microscopia e da Imagem Lactente no University Of California, San Diego, e sua equipe será responsável para desenvolver maneiras eficazes e intuitivas para que os usuários interajam com a Grade Cardiovascular da Pesquisa.
“O cyberinfrastructure Tornando-se e de distribuição para capitalizar em tecnologias emergentes para promover a melhor colaboração e para acelerar a pesquisa é um foco do núcleo dos esforços do nosso centro,” disse Ellisman, que igualmente é director do Centro do UCSD para a Pesquisa em Sistemas Biológicos. “Com uma reputação de desenvolver o cyberinfrastructure evolutivo para promover investigações interdisciplinars entre equipes dos pesquisadores na microscopia, de neuroimaging e das ciências da saúde ambiental, CRBS está ansiosa para colaborar com a equipe de Johns Hopkins em desenvolver a Grade Cardiovascular da Pesquisa. Nós estamos olhando para a frente a executar uma infra-estrutura que associe eficazmente a experiência, as aplicações e a instrumentação diversas da comunidade de pesquisa cardiovascular em uma base de conhecimento unificada, uma que permitirá pesquisadores de abordar estudos cardíacos da doença do maiores espaço e complexidade.”
A Grade Cardiovascular da Pesquisa será sediada na Construção da Ciência Computacional e de uma Engenharia de 79.000 pés quadrados, agora sob a construção no terreno de Homewood de Johns Hopkins. A construção é esperada abrir este verão.
http://www.jhu.edu