“Un supermap„ interattivo che illustra le mutazioni e la diffusione dell'influenza aviaria intorno al globo dovrebbe aiutare col passare del tempo meglio i ricercatori ed i responsabili politici a capire il virus ed a prevedere ulteriori scoppi, secondo un nuovo studio che comprende Università di Colorado ai ricercatori di Ohio State University e di Boulder.
Il gruppo di ricerca ha usato i dati dall'evoluzione e dalla diffusione conosciute dell'influenza aviaria, conosciute come H5N1, per creare una carta stradale della diffusione virale nel tempo e nello spazio, ha detto l'Assistente Universitario Robert Guralnick, un co-author dell'ecologia diCu-Boulder e di biologia evolutiva di studio. Il gruppo ha aggettato le informazioni genetiche e geografiche su un globo interattivo facendo uso della tecnologia di Google Earth, permettendo che gli utenti volino virtualmente intorno al pianeta ed analizzino i movimenti ed i cambiamenti nei genoma, o i materiali genetici, degli sotto-sforzi conosciuti di influenza aviaria che sono stati ordinati nel 1996 da quando il virus in primo luogo è stato individuato in Guangdong, Cina.
I ricercatori hanno usato la tecnologia novella per tracciare una carta della diffusione di H5N1 attraverso l'Asia, Indonesia, Medio Oriente ed Europa dai vari host, compreso il suo trasporto dagli ordini specifici degli uccelli e dei mammiferi, ha detto la Collina di Andrew del dottorando diCu-Boulder, un co-author di studio. Egualmente hanno usato il supermap per tenere la carreggiata i tratti genetici chiave prevalenti in alcuni genoma di influenza aviaria a cui compaia confer all'abilità di H5N1 più prontamente infettano i mammiferi, compreso gli esseri umani, ha detto.
“Questo è un metodo completamente nuovo di integrazione e conoscenza dividente circa la diffusione di malattia, dando alla gente un rapido e un modo semplice avere significato dei cambiamenti,„ ha detto la Collina, architetto principale della parte di visualizzazione del progetto di ricerca di collaborazione. Un documento da un gruppo piombo da Daniel Janies dell'Ohio State University e di Guralnick di coinvoluzione, Collina e Museo Americano dei ricercatori Eric Waltari di Storia Naturale E del Carraio del Reparto sta pubblicando nell'emissione di Aprile di Biologia Sistematica.
Come la legenda di una carta stradale, i colori ed i simboli sul supermap indicano quale tipi di host portano il virus o la distribuzione dei genotipi di interesse, hanno detto la Collina. “Questo permette noi verifichiamo le ipotesi sulla ripartizione geografica degli sforzi che contengono che ricerche di laboratorio hanno suggerito sono i genotipi chiave che permettono che gli sforzi aviari del virus dell'influenza infettino i mammiferi,„ Hill hanno detto.
Il gruppo ha studiato i dati genomica di sequenza da 351 sforzo differente dell'influenza aviaria raccolta nel campo, ha detto Guralnick, che è egualmente Curatore della Zoologia Invertebrata all'Università di Museo di Colorado. Un clic dagli utenti “sugli isolati„ virali genera le finestre del computer che rivelano le mutazioni diagnostiche che rendono ogni sforzo unico e le informazioni sono collegate dal computer agli Istituti Nazionali del GenBank della Salubrità, un database che contiene più di 75 milione registrazioni di sequenza.
Come componente dello sforzo, il gruppo ha esaminato due proteine chiave trovate sulla superficie degli sforzi H5N1 conosciuti come hemaglutinin, o HA e neuraminidasi, o NA. Gli Scienziati ritengono se uno sforzo virulento di H5N1 si adatta per riuscire alla trasmissione da uomo a uomo, probabilmente comprenderebbero le mutazioni dalle due proteine, hanno detto Guralnick. Nessuna mutazione connessa con NA e l'HA è stata collegata a tutto l'uccello specifico o host del mammifero, ha detto.