突然変異を描写し、鳥インフルエンザの広がりが世界中から一定時間にわたり研究者および政策当局者がウイルスを理解し、それ以上の発生を予想するのをよりよく助けるべきであるボールダーおよびオハイオ州立大学の研究者でコロラド州の大学を含む新しい調査に従う対話型の 「supermap」。
調査チームは知られていた改革からのデータを使用し、時間と空間でウイルスの広がりの道路地図を作成すると H5N1 として、知られていた鳥インフルエンザの広がりは Cu ボールダーの生態学および進化生物学の助教授を言いましたロバート Guralnick、調査の共著者。 チームは Google Earth の技術を使用してウイルスが広東省、中国で最初に検出されてから対話型の地球に遺伝および地理的な情報を写し出しま、惑星のまわりで事実上飛び、ゲノムの動きそして変更を、か 1996 年に配列された知られていた鳥インフルエンザの副緊張の遺伝の青写真が分析するように、ユーザーします。
研究者はアジア、インドネシア、中東を通して H5N1 の広がりを図表にするのに新しい技術を使用し、鳥およびほ乳類の特定の発注による輸送を含むさまざまなホストによるヨーロッパは、 Cu ボールダーの大学院生のアンドリューの丘、調査の共著者を言いました。 彼らはまた能力もっと容易に感染させるほ乳類を H5N1 の相談するであって下さいある鳥インフルエンザのゲノムで流行する主遺伝の特性を追跡するのに supermap を使用しました人間を含んでと、彼は言いました。
「これは統合の全く新しい方法であり、病気の広がりについての共有の知識、人々に変更の意味を成す速く、簡単な方法を与えます」丘、共同の研究計画の視覚化の部分の主な建築家を言いました。 オハイオ州立大学および包含 Guralnick のダニエル Janies、丘およびアメリカ自然史博物館の研究者および区の荷車引きエリック Waltari によって導かれる組織的生物学の 4 月問題でチームによるペーパーは出版されています。
道路地図の伝説のように、どのタイプのホストが興味の遺伝子型のウイルスか分布を運ぶか supermap のカラーそして記号は、言いました丘を明記します。 「これはどんな実験室調査がであるインフルエンザウイルスの Avian 緊張がほ乳類を感染させるようにする主遺伝子型と」 Hill 言った提案したか私達が含んでいる緊張の地理的配分の仮説をテストすることを可能にします。
チームはフィールドで集められた鳥インフルエンザの 351 の緊張からの genomic シーケンスデータを言いましたまたコロラド州博物館の大学に無脊髄動物学の管理人である Guralnick を調査しました。 ウイルスの 「隔離集団」のユーザーによるクリックは各緊張を一義的にする、情報は健康の GenBank の各国用協会、 75以上 ,000,000 のシーケンスレコードを含んでいるデータベースへのコンピュータによってリンクされます診断突然変異を明らかにするコンピュータの Windows を生成し。
努力の一部として、チームは hemaglutinin として、か HA 知られていた見つけられた H5N1 緊張の表面で 2 つの主蛋白質およびノイラミニダーゼ、または NA 見ました。 科学者は H5N1 の劇毒性の緊張が人から人への伝達で成功するために適応すればそれ多分含みます突然変異を、言いました Guralnick を考えます 2 つの蛋白質によって。 NA および HA と関連付けられた突然変異はあらゆる特定の鳥にリンクされませんでしたまたはほ乳類のホストと、彼は言いました。