Um “supermap interactivo” que retrate as mutações e a propagação da gripe aviária ao redor do mundo ao longo do tempo deva ajudar pesquisadores e fabricantes de política melhor a compreender o vírus e a antecipar umas manifestações mais adicionais, de acordo com um estudo novo que envolve a Universidade Do Colorado em pesquisadores de Boulder e de Universidade Estadual do Ohio.
A equipa de investigação usou dados da evolução e da propagação conhecidas da gripe aviária, conhecidas como H5N1, para criar em tempo e em espaço um mapa rodoviário da propagação viral, disse o Professor Adjunto Robert Guralnick da ecologia de CU-Boulder e da biologia evolutiva, um co-autor do estudo. A equipe projectou a informação genética e geográfica em um globo interactivo usando a tecnologia de Google Earth, permitindo que os usuários voem virtualmente em torno do planeta e analisem movimentos e mudanças nos genomas, ou os modelos genéticos, das secundário-tensões conhecidas da gripe aviária que têm sido arranjadas em seqüência desde que o vírus foi detectado primeiramente em Guangdong, China, em 1996.
Os pesquisadores usaram a tecnologia nova para fazer um mapa da propagação de H5N1 através de Ásia, Indonésia, o Médio Oriente e Europa pelos vários anfitriões, incluindo seu transporte por pedidos específicos dos pássaros e dos mamíferos, disse o Monte de Andrew do aluno diplomado de CU-Boulder, um co-autor do estudo. Igualmente usaram o supermap para seguir os traços genéticos chaves predominantes em alguns genomas da gripe aviária a que apareça confer à capacidade de H5N1 contaminam mais prontamente os mamíferos, incluindo seres humanos, disse.
“Este é um método completamente novo da integração e conhecimento de partilha sobre a propagação da doença, dando a povos um rápido e uma forma facil fazer o sentido das mudanças,” disse o Monte, arquiteto principal da parcela do visualização do projecto de investigação colaborador. Um papel por uma equipe conduzida por Daniel Janies da Universidade Estadual do Ohio e do Guralnick do envolvimento, Monte e Museu Americano de pesquisadores Eric Waltari da História Natural e de Veículo com rodas da Divisão está sendo publicado na introdução de Abril da Biologia Sistemática.
Como a legenda de um mapa rodoviário, as cores e os símbolos no supermap indicam que tipos de anfitriões levam o vírus ou a distribuição dos genótipo do interesse, disseram o Monte. “Isto permite nós testem hipóteses na distribuição geográfica das tensões que contêm que estudos de laboratório sugeriram são os genótipo chaves que permitem que as tensões aviárias do virus da gripe contaminem mamíferos,” Monte disseram.
A equipe estudou dados genomic da seqüência de 351 tensões diferentes da gripe aviária recolhida no campo, disse Guralnick, que é igualmente Curador do Zoologia do Invertebrado no Museu da Universidade Do Colorado. Um clique por usuários em “isolados virais” gera os indicadores do computador que revelam as mutações diagnósticas que fazem cada tensão original, e a informação é ligada pelo computador aos Institutos Nacionais do GenBank de Saúde, uma base de dados que contem mais de 75 milhão registros da seqüência.
Como parte do esforço, a equipe olhou duas proteínas chaves encontradas na superfície das tensões H5N1 conhecidas como o hemaglutinin, ou HA, e neuraminidase, ou NA. Os Cientistas pensam se uma tensão virulento de H5N1 se adapta para suceder na transmissão de humano a humano, ele envolveriam provavelmente mutações pelas duas proteínas, disseram Guralnick. Nenhuma mutação associada com o NA e o HA foi ligada a todo o pássaro específico ou anfitrião do mamífero, disse.