Published on May 1, 2007 at 8:17 AM
互动“超图”描绘的突变和随着时间的推移世界各地的禽流感传播,帮助研究人员和决策者更好地了解病毒和预期进一步爆发,根据一项新的研究涉及科罗拉多大学博尔德分校和美国俄亥俄州立大学研究人员。
该研究小组使用,为H5N1型,从已知的演变和传播禽流感的数据创建一个病毒的传播在时间和空间的路线图,表示科罗拉多大学博尔德分校生态学和进化生物学助理教授罗伯特Guralnick,研究的共同作者。队投射到一个互动的使用谷歌地球技术全球的遗传和地理信息,使用户能够在围绕地球飞行几乎和分析以来,已测序的运动和变化中的基因组,或已知的禽流感病毒株的遗传蓝图,病毒首次被发现于1996年在中国广东省。
科罗拉多大学波尔德分校的研究生安德鲁山,研究说,研究人员使用的新技术图表,通过亚洲,印度尼西亚,中东和欧洲的H5N1病毒扩散的各种主机,包括其具体命令的鸟类和哺乳动物的运输合作作者。他说,他们还使用了超图来跟踪关键似乎赋予了H5N1病毒的能力,以便更容易感染哺乳动物,包括人类的一些禽流感病毒基因组中普遍存在的遗传性状。
“这是一个完全新的方法,整合和分享有关疾病的蔓延知识,给人一种快速,简便的方法,使意识的变化,”希尔说,总设计师的合作研究项目的可视化部分。由俄亥俄州立大学的丹尼尔贾妮斯和涉及Guralnick,希尔和美国自然历史博物馆的研究人员埃里克Waltari和沃德惠勒博物馆领导的一个研究小组的论文发表在4月的系统生物学问题。
希尔说,就像传说中的路线图,颜色和符号的SuperMap的指示哪些类型的主机携带病毒或基因型的利益分配。 “这让我们测试的菌株含有什么实验室的研究表明,使禽流感毒株的流感病毒感染哺乳动物的主要基因型的地理分布的假设,”希尔说。
Guralnick,谁也无脊椎动物动物在科罗拉多大学博物馆馆长说,该小组研究了在现场收集到的禽流感不同从351株基因组序列数据。病毒“株”用户点击生成计算机的Windows揭示,使每一株独特的诊断基因突变,信息是通过计算机与卫生GenBank中的国家机构,一个数据库,包含超过75万个序列记录。
作为努力的一部分,该研究小组在两个关键hemaglutinin已知的H5N1病毒表面发现的蛋白质,或房委会,和神经氨酸酶,或NA。科学家们认为,如果H5N1病毒毒株适应人类传人成功,这将可能涉及的两种蛋白质的突变,说Guralnick。他说,没有与NA和HA相关的突变与任何特定的鸟类或哺乳动物主机。
但球队没有找到一个特定的基因型,赖氨酸- 627之间的强关联,称为聚合酶碱性蛋白,或PB2的病毒基因组的段,并在外地的哺乳动物主机。 “虽然这个基因型对哺乳动物不是排他性的,我们认为重要的是要跟踪的PB2基因突变是如何传播,因为它似乎是在小鼠体内的感染和致命的,说:”贾妮斯。
该小组还使用了超图可视化在世界各地的H5N1病毒扩散的具体命令的鸟类和哺乳类动物,包括水禽,家禽,涉禽,猛禽,鸣禽,蹄类哺乳动物和食肉动物,说Guralnick。
希尔说,在一个实例中的超图显示一条直线,从泰国蔓延到欧洲,在一个单一的迅速事件,这说明2004年的事件时,一些受感染的鹰走私进入比利时。而鸟类立即抓住和密闭,防止进一步扩散,事件的SuperMap的写照照亮非法野生动物交易可以触发病毒运输的巨大跨越。
在广东省水生野生鸟类在1996年被首次发现禽流感疫情,并蔓延到鸡和1997年在香港几个人。从1997年到2005年,该病毒出现在几个东南亚国家,并通过多台主机蔓延到日本,韩国,俄罗斯,中东和印度。在过去两年中,该病毒已蔓延到西欧和韩国再次出现。
虽然H5N1型不高传染性对人类或人类之间,专家们担心,未来的基因突变,有可能使禽流感显著更多的传染性。据世界卫生组织,最初在1996年爆发以来,包括164人死亡以来,已有269例人类疾病。据亚特兰大疾病控制中心,禽流感疫情可能感染15%的美国人口的35%,成本超过1000亿美元。
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