En växelverkande ”supermap”, som beskriver mutationarna, och spridning av den avian influensan runt om jordklotet med tiden bör hjälpa bättre forskare och politiktillverkare att förstå viruset och att förutse mer ytterligare utbrott, enligt en ny studie som gäller Universitetar av Colorado på Stenblock- och Ohio Delstatsuniversitetforskare.
Använda datan för forskning laget från den bekant evolutionen och spridningen av den avian influensan som, de var bekant som H5N1, att skapa ett kretsschema av virus- spridning i tid och utrymme, sade CU-Stenblocket ekologi och den evolutions- biologiAssistentProfessorn Robert Guralnick, en studieco-författare. Laget projekterade genetiska och geografiska informationen på ett växelverkande jordklot genom att använda Google Earth teknologi och att låta användare flyga faktiskt runt om planet och analysera förehavanden och ändringar i genom eller genetiska ritningar, av bekant avian influensa under-anstränger som har ordnats, sedan viruset avkändes först i Guangdong, Kina, i 1996.
Forskarna använde den nya teknologin för att kartlägga spridningen av H5N1 till och med Asien, Indonesien, Mellanösten, och Europa vid olikt varar värd, inklusive dess transport vid närmare detalj beställer av fåglar, och däggdjur, sade CU-Stenblocket doktorandAndrew Kullen, en studieco-författare. De använde också supermapen för att spåra nyckel- genetiska drag som var förhärskas i några avian influensagenom som verka att tilldela kapaciteten av H5N1 till smittar klarare däggdjur, inklusive människor, sade han.
”Är Denna en fullständigt ny metod av att integrera, och dela kunskap om sjukdomspridning och att ge folk en ömt ställe och lätt långt att göra avkänning av ändringarna,”, sade Kullen, den högsta arkitekten av visualizationen portionr av den kollaborativa forskningen projekterar. Ett pappers- av ett lag ledde vid Daniel Janies av den Ohio Delstatsuniversiteten och att gälla det Guralnick, Kull- och AmerikanMuseet av Naturhistoriaforskare Eric Waltari och Avvärjer Person som drar en skottkärra publiceras i April utfärdar av Systematisk Biologi.
Gilla legenden av ett kretsschema, färgar, och symboler på supermapen indikerar att vilka typer av varar värd, bär viruset, eller fördelningen av genotypes av intresserar, sade Kullen. ”Låter Detta oss testa hypoteser på den geografiska fördelningen av anstränger som innehåller vilka laboratoriumstudier har föreslågit är de nyckel- genotypesna som låter avian anstränger av influensaviruset för att smitta däggdjur,”, sade Kull.
Laget som utstuderade genomic ordnar data från olika 351, anstränger av den avian influensan som samlas i sätta in, sade Guralnick, som är också Intendentet av InvertebrateZoologin på Universitetar av det Colorado Museet. En klicka av användare på virus- ”isolater” frambringar datorfönster som avslöjer diagnostiska mutationar som gör varje att anstränga unikt, och informationen anknytas av datoren till MedborgareInstituten av Hälsas GenBank, en databas som mer innehåller, än 75 miljoner ordnar rekord.
Som delen av försöket anstränger laget som ses två nyckel- proteiner som finnas på ytbehandla av H5N1, bekant som hemaglutinin, eller HA, och neuraminidasen eller NA. Forskare som funderare, om ett virulent anstränger av H5N1 anpassar för att lyckas på människa-till-människan överföringen, det, skulle gäller troligen mutationar vid de två proteinerna, sade Guralnick. Inga mutationar som var tillhörande med NA och HA, anknöts till någon specifik fågel, eller däggdjur varar värd, sade han.