ここの科学者ははじめてウイルスの次の発生が発生するためにが本当らしいどこにのか予測を助けるかもしれない遺伝、地理的なおよび発展情報を組み込む鳥インフルエンザのウイルス (H5N1) の広がりの新しい、対話型のマップを設計しました。
プロセスでは、彼らはまた西方に先頭に立つような、人間を感染させる機能があるウイルスの特定の緊張の性質についての仮説をテストしました。
ウイルスの突然変異の発展の木を作成するためにダニエル Janies 著、生物医学的な情報科学導かれる、生物医学的な専門家のチーム使用された特別なソフトウェアの部門の助教授。 それらは Google Earth で地球に木を写し出すのに鍵穴のマークアップ言語を使用し、次にウイルスを運ぶ、そしてどこに住んでいる異なった明記するためにカラーおよび記号をホスト選択しました。 時間、ウイルスの広がりをここ十年間活気づけるそれらを与えられる Google Earth の別の機能。
マップは追加情報で満杯です。 特定のウイルスのサブタイプのクリックは別のものとウイルスの 1 つの緊張を区別する、データすべては健康の GenBank の各国用協会にリンクされます診断突然変異を明らかにするポップアップ Windows を生成し。
「マップ私達に処置のウイルスを見る全新しい方法を与え、それがで、していないもの理解します」、は Janies を言います。 「それは私達が実験室調査から」。来る H5N1 の広がりについての既存の仮説に対して現実の世界のウイルスについての調査結果を比較することを可能にしました
調査は組織的生物学の 4 月問題のオンライン今週現われます。
鳥インフルエンザのウイルスは広東省、 1996 年に中国の野生の水鳥で最初に認識されました。 それは香港の鶏そして人間にそれから次の年広がりました。 2005 年までの 1997 年から、それは中央および南中国、ロシア、中東およびインド全体の多重ホストで複数の東南アジアの国におよび広がり現れました。 今まで、追加発生はヨーロッパおよびアフリカと日本、韓国およびインドネシアとして極東としてずっと西にとして報告されました。
supermap の作成で、研究者はウイルスの 351 の隔離集団からの遺伝データを調査しました。 彼らはある特定のホストがウイルスの特定の形式を運んでいたウイルスが特定の突然変異を運び、かどうか検出に特に興味がありま伝達を人間に可能にします。
「私達は情報の多重層の視覚化を私達が私達が発展の木で組織した突然変異データの統計分析によって見つけました」、テストできる仮説の生成で非常に有用 Janies を言います。 「調査結果私達が」。は広がったのである特定のホストか地域と関連付けられるようである突然変異思いがけなく現われるか、またはかどうかウイルスの本当の適応だったかどうか理解するのを助けました
インフルエンザのウイルスは複数の規準に従って分類されます: 彼らはウイルス、 hemaglutinin およびノイラミニダーゼの表面で置かれる 2 つの主蛋白質の動物か人間および作業 (HA)から来るかどうか (NA)。 HA は宿主細胞にウイルス 「棒」を助け、感染させます; NA はウイルスがセルから脱出し、他のセルおよびホストに広がるのを助けます。 以前、科学者はウイルスその可能にされた人から人への伝達の緊張が現れたら、これら二つの蛋白質でおそらく突然変異を含むことを仮定しました。
Janies および彼の同僚は遺伝子型をあらゆる特定のタイプのホストとかなり関連付けられたこれら二つの表面蛋白質の突然変異と関連付けられて見つけませんでした。 しかし彼らは特定の遺伝子型 (ウイルスのポリメラーゼ基本的な蛋白質のリジン627) とフィールドの哺乳類のホスト間の強い連合を見つけました。
「この遺伝子型はほ乳類に排他的ではないが、私達はマウスでとても伝染性そして致命的ようであるのでこの特定の突然変異が」言う Janies をどのように広がっているか追跡することは重要であることを考えます。