Naukowowie tutaj projektowali nową, interaktywną mapę rozszerzanie się ptasiej grypy wirus który pierwszy raz wciela genetyczną, geograficzną i ewolucyjną informację, która może pomagać przepowiadać, (H5N1) dokąd następny wybuch wirus jest prawdopodobny zdarzać się.
W procesie, także badali hipotezy o naturze odmianowi napięcia które pojawiać się są przewodzić westward i zdolność infekować istoty ludzkie. wirus
Drużyna biomedyczni eksperci, prowadząca Daniel Janies tworzyć ewolucyjnego drzewa wirus mutacje, asystent profesora w dziale biomedyczny informatics, używać specjalny oprogramowanie. Używali Keyhole marży języka w Google Earth projektować drzewa na kuli ziemskiej i wtedy wybierali wskazywać kolory, symbole i różnych gospodarzów, dokąd które niesie wirusa i żyją. TimeSpan, inna funkcja w Google Earth, pozwolić one animować rozszerzanie się wirus nad past dekadą.
Mapa jest pełna dodatkowe informacje. Klikać na odmianowym wirusowym podtypie wytwarza podręczne nadokienne odkrywcze diagnostyczne mutacje które odróżniają jeden napięcie wirus od inny, i wszystko dane łączy Krajowy instytut Health genBank.
Mapa daje my całemu nowemu sposobowi widzieć wirusa w akci i rozumiejący, "co jest i no robi ja" mówi Janies. "Ja umożliwiał my porównywać znalezienia o wirusach w świacie rzeczywistym przeciw istniejącym hipotezom o rozszerzaniu się H5N1 które przychodzą od laboranckich studiów."
Nauka pojawiać się online ten tydzień w Kwietnia zagadnieniu Systematyczna biologia.
Ptasiej grypy wirus był pierwszy rozpoznającym w dzikich nadwodnych ptakach w Guangdong, Chiny w 1996. Ja wtedy rozprzestrzenia kurczaki i istoty ludzkie w Hong Kong następujący rok. Od 1997 do 2005, ja wyłaniał się w kilka Azji Południowo Wschodniej krajach, rozszerzanie się przez wielokrotność gospodarzów przez cały i. centrali, południowy Chiny, Rosja, Środkowy Wschód i India Do teraz, dodatkowi wybuchy donosili jako daleki zachód jako, jako daleki wschód jako Europa i Afryka i. Japonia, Korea i Indonezja
W tworzyć supermap, badacze studiowali genetycznych dane od 351 odizolowywają wirus. Byli szczególnie zainteresowani w odkrywać jeżeli pewni gospodarzi nieśli odmianowe formy wirus i który nieśli odmianowe mutacje wirusy umożliwiający przekaz istoty ludzkie.
"zakładamy unaocznienie wieloskładnikowe warstwy ewidencyjny bardzo pomocniczo w wywołujących hipotezach mogliśmy badać przez statystycznej analizy mutacja dane organizowaliśmy w ewolucyjnym drzewie," mówi Janies. "znalezienia pomóc my rozumieć czy mutacje, czy które pojawiać się kojarzący z pewnymi gospodarzami lub geograficznymi regionami pojawiać się szansą, lub one był prawdziwymi adaptacjami wirus jako ono rozprzestrzeniający."
Grypowi wirusy klasyfikują według kilka kryteriów: czy przychodzą od zwierząt, istot ludzkich lub aktywności dwa kluczowej proteiny która siedzą na powierzchni wirus (HA), hemaglutinin i neuraminidase (NA)., BRZĘCZENIA pomagają i infekują je wirusowemu "kijowi" gospodarz komórka; NA pomaga wirusowej ucieczce od komórki, rozszerzaniu się i. inni gospodarzi i komórki W przeszłości, naukowowie hypothesized że jeżeli napięcie wirus wyłaniał się ten umożliwiającego człowiek od człowieka przekaz, ono prawdopodobnie wymaga mutacje w te dwa proteinach.
Janies i jego koledzy no znajdowaliśmy jakaś genotypów kojarzących z mutacjami w te dwa nawierzchniowych proteinach które znamiennie kojarzyli z jakaś odmianowym typ gospodarz. Jakkolwiek, znajdowali silnego skojarzenia między odmianowym genotypem i ssaków gospodarzami w polu. (Lysine-627 w polymerase podstawowej proteinie wirus)
Podczas gdy ten genotyp no jest wyłączny ssaki, myśleć je jesteśmy znacząco tropić jak ten szczególna mutacja rozprzestrzenia" mówi Janies. "ponieważ ono pojawiać się jest w ten sposób śmiertelny w myszach i infective,"